同时注意构象搜索问题，这两个问题要想同时考虑的话，可以把不同羧基上解离氢原子的情况也看作不同的构象，一并计入构象平均（对每种电离形式作构象搜索）

sobereva 发表于 2023-7-13 12:12
看哪种质子解离的方式自由能最低便知哪种结构占主导
凭直觉也可以估计，比如离得近的两个羧基相对来说不容 ...

谢谢sob老师，那可能我还是要计算来检验下。

看哪种质子解离的方式自由能最低便知哪种结构占主导
凭直觉也可以估计，比如离得近的两个羧基相对来说不容易同时质子解离，因为这样会导致两个COO-之间的静电互斥令能量较高
不要轻易信某些程序提供的某些功能。要从原理上思考某些程序提供的一些功能是否靠谱，或可能存在哪些局限性。