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psi4计算时报错显示：Fatal Error: WRITE failed. Only some of the bytes were wr...

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孙荣德

发布时间: 2023-7-14 13:18

正文摘要:

各位老师好,我在用PSI4计算离子液体与添加剂体系时出现报错，报错内容如下：（输入文件和输出文件详见附件） Traceback (most recent call last): File "/public3/home/sc55307/Softw ...

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孙荣德 发表于 Post on 2023-7-16 15:59:20

zjxitcc 发表于 2023-7-16 13:53
“用超算算这个体系”、“超算中心的容量够的话”这些表述不严谨，你应该只是使用了超算中心的一个计算节 ...

好的，谢谢老师

zjxitcc 发表于 Post on 2023-7-16 13:53:54

孙荣德发表于 2023-7-16 01:08
好的，谢谢老师的耐心解答。还有一个问题想请教老师，我用超算算的时候也是这样，是不是用超算算这个体系 ...

“用超算算这个体系”、“超算中心的容量够的话”这些表述不严谨，你应该只是使用了超算中心的一个计算节点而已，不是使用了整个超算中心（巨量资源）。PSI4的SAPT计算也没法跨节点并行。当前体系很大，你计算级别要求很高，用一个节点不可能算得出来。建议换成GKS-EDA，同时还可以用frag_guess_wfn小程序加速计算。

孙荣德 发表于 Post on 2023-7-16 01:08:55

本帖最后由孙荣德于 2023-7-16 11:59 编辑

sobereva 发表于 2023-7-15 19:38
大抵硬盘满了之类
当前级别对于这么大体系计算很费劲，也非常耗硬盘

好的，谢谢老师的耐心解答。还有一个问题想请教老师，我用超算算的时候也是这样，是不是用超算算这个体系的话也很费劲？一般也算不出来？还是超算中心的容量够的话还是可以实现？

sobereva 发表于 Post on 2023-7-15 19:38:02

大抵硬盘满了之类
当前级别对于这么大体系计算很费劲，也非常耗硬盘

强烈建议用sobEDA方法基于Gaussian+Multiwfn做能量分解，精度理想，普适性极强，耗时仅为DFT计算的两三倍，几百原子都能算得动，对内存和硬盘几乎都没要求，操作还特别容易，看原文里给的教程
ChemRxiv (2023) DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-n79rz

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