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请教CP2K输出文件的问题

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发布时间: 2023-7-18 10:08

正文摘要:

请问老师们 优化后的结构我应该在哪个文件如何打开啊? 2.输入文件编译了mol文件的输出,但输出没有mol文件应该怎么办?

回复 Reply

clearlove 发表于 Post on 2023-8-1 17:09:26
乐平 发表于 2023-7-19 10:20
真的吗? 请看截图,您在上传的 MIX3.inp 文件的哪里写了 print mol ?

不好意思 是我没看到 谢谢了
clearlove 发表于 Post on 2023-8-1 17:09:02
sobereva 发表于 2023-7-20 13:11
restart文件里就有最终结构,而且是全精度储存,拷出来就完了。还可以将之载入Multiwfn,用主功能100的主功 ...

谢谢您 已经解决
sobereva 发表于 Post on 2023-7-20 13:11:43
restart文件里就有最终结构,而且是全精度储存,拷出来就完了。还可以将之载入Multiwfn,用主功能100的主功能2转成丰富的格式,诸如cif、xyz、pdb、gjf等等
乐平 发表于 Post on 2023-7-19 10:20:12
clearlove 发表于 2023-7-18 11:48
谢谢您 是我的表达有问题 但是我也写了print mol在后面 您可以看看 是不是因为K点体系无法输出呢

真的吗? 请看截图,您在上传的 MIX3.inp 文件的哪里写了 print mol ?




即使我搜 MOL, mol 也只搜到 BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH-qXX,这里的 XX 指代文件里的 q12, q17, q6, q18,以及 &MO_MOLDEN, &END MO_MOLDEN 这些关键词。根本就没有在您上传的 MIX3.inp 文件里找到 print mol

请您自己好好检测一下吧
clearlove 发表于 Post on 2023-7-18 11:48:51
谢谢您 是我的表达有问题 但是我也写了print mol在后面 您可以看看 是不是因为K点体系无法输出呢
乐平 发表于 Post on 2023-7-18 10:40:02
本帖最后由 乐平 于 2023-7-18 10:52 编辑

XXXX-pos-1.pdb 文件是最终的结构文件,其中 XXXX 是你自己命名的体系名,比如你截图里的 MIX2, pos 是 position 的缩写,而 .pdb 是以 pdb 格式保存的文件后缀名。


什么叫“输入文件里‘编译’了 mol 文件的输出”……

你输出的格式明明写的是 pdb
  1. &PRINT
  2.   &TRAJECTORY
  3.     FORMAT pdb
  4.   &END TRAJECTORY
复制代码


在你上传的 MIX3.inp 文件末尾倒数第十行至倒数第八行

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