老师您好，您做的reaxtools工具非常有用，十分感谢！我现在还有几个问题：（1）web页面上给出的结果中Reactions和Atom transfer是什么意思呢？（2）能给出具体的反应方程式嘛？（3）现在只有类似C4H5这种化学式，能查看具体的结构式吗？可能这就得需要化学键的信息了，到底是单键还是双键还是三键；（4）十分感谢！

yanboliu123 发表于 2025-9-24 09:49
老师您好，今天网页端无法识别出H原子，您看看是什么原因呢？                                            ...

已解决！

老师您好，今天网页端无法识别出H原子，您看看是什么原因呢？                                                                                                                                                                 “=== Reax Tools Trajectory Analysis (Web Interface) ===
Input file: pyrolysis.lammpstrj, output dir: output/
Atom Types: 1: C, 2: ,
Frame: 7, Atoms: 400, Bonds: 106, Mols: 294, PBC: 34.2 34.2 34.2                  

Note: The number of frames is less than 10.
=== Species Report ===
formula                begin     mid     end
                      200.00  200.00  200.00
C2                    100.00   91.00   85.00
C4                      0.00    4.00    7.00
C                       0.00    2.00    2.00”

she529 发表于 2025-8-17 20:16
大佬，这工具很顶啊  这个网页版本有办法离线使用吗？服务器的局域网不让联网- -！

GITHUB上拉取linux本地版，画图拿附带的python脚本和graphviz画

大佬，这工具很顶啊  这个网页版本有办法离线使用吗？服务器的局域网不让联网- -！

很有帮助！感谢大佬

Graphite 发表于 2025-6-20 17:10
1.9web 重要更新

网页版打不开呢，老师 显示无法访问此页面，挂梯子也打不开

1.9web 重要更新

Graphite 发表于 2025-6-16 20:51
运行时间是分钟级的，正常情况下是每分钟至少100MB的速度，不知道你什么环境
图1没成键一般要么原子类型 ...

好的好的，感谢老师

uranusshi 发表于 2025-6-17 23:50
老师，再问下species_count.csv，bond_count.csv，ring_count.csv这三个文件如何生成？

如果文件轨迹格式正确、输入正确的话这些都是自动的

老师，再问下species_count.csv，bond_count.csv，ring_count.csv这三个文件如何生成？

Graphite 发表于 2025-6-17 16:56
id type x y z，OVITO转xyz的话，出来的xyz(extended)格式差不多像这样：

2640

感谢，轨迹文件改了个名字就好了，我原来用的是xxx.dump

uranusshi 发表于 2025-6-17 00:38
老师，标准的lammps.trj文件格式是什么啊，我的输出轨迹文件是这样的，运行以后也没有报错，但就是不出csv ...

id type x y z，OVITO转xyz的话，出来的xyz(extended)格式差不多像这样：

2640
Lattice="....", ....
C 0.0 0.0 0.0
....
2640
Lattice="....", ....
C 1.0 0.0 0.0
....