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求助低共熔溶剂模拟中遇到的问题

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xptracy

发布时间: 2023-7-26 21:56

正文摘要:

本帖最后由 xptracy 于 2023-7-29 09:59 编辑参考文献https://www.sci-hub.ru/10.1016/j.foodchem.2021.131042 文献主要方法：采用Amber(99SB-ildn)力场，使用GROMACS2019.6软件包进行分子动力学模 ...

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luxin 发表于 Post on 2025-9-12 14:18:33

请问阳离子和阴离子在高斯中怎么画阿，gaussview06没找到加电荷的地方，高斯中优化的时候溶剂模型选什么呢。另外使用packmol建模的时候，是把在高斯中优化好的结构转成PDB格式作为起始么

richer 发表于 Post on 2024-3-5 19:34:14

请问这个GROMACS算起来难吗？我的备选方案是做分子动力学，也涉及低共熔溶剂，但你的帖子看起来好复杂，好怕学不会（因为属于课题很小的一部分不敢浪费时间

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