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ORCA石英超晶胞中Al杂质点缺陷计算求助

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发布时间: 2023-7-27 20:34

正文摘要:

尊敬的各位大神,老师们好!本人想要请教ORCA石英超晶胞中缺陷计算问题。 我的α石英原始结构来自于materialsproject mp-7000, 扩胞为3*3*3超胞后,将处在最中间原胞Wyckoff位置的Si替换为了Al,该过程使用的是 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-7-28 23:01:18
BruceLee1222 发表于 2023-7-27 21:20
非常感谢您百忙之中的回复,发现没有自己想的那么多,是一个低级错误。。。内存给太大了导致并行报错,调 ...

离子和半离子晶体适合背景电荷+capped ECP方式处理,如Al2O3、CaO、TiO2等。Si、SiO2这种无极性或极性共价键被截断处用加氢饱和就够了。
wzkchem5 发表于 Post on 2023-7-28 15:55:52
BruceLee1222 发表于 2023-7-27 14:20
非常感谢您百忙之中的回复,发现没有自己想的那么多,是一个低级错误。。。内存给太大了导致并行报错,调 ...

这种晶体里的键主要是共价成分,离子成分比较小,所以建议用氢原子饱和的方法。Al2O3或许用离子QM/MM也可以做,不过我不确定
BruceLee1222 发表于 Post on 2023-7-27 21:28:29
sobereva 发表于 2023-7-27 21:03
删了gbw或者加上noautostart

用ORCA当做簇模型时记得对边界用氢进行饱和,别直接计算。

非常感谢老师,学会了,难怪之前看的ORCA对晶体EPR计算的文献都是去氧,加氢,对新获得的cluster进行计算。听君一席话,胜读十年书!!!
BruceLee1222 发表于 Post on 2023-7-27 21:20:15
wzkchem5 发表于 2023-7-27 20:48
做计算最忌讳的就是不看、不分析报错信息。
根据这两行,你应该能自己推断出发生了什么事情:
The File:  ...

非常感谢您百忙之中的回复,发现没有自己想的那么多,是一个低级错误。。。内存给太大了导致并行报错,调小内存后,未删除gbw等中间文件就重新提交了。。。删除中间文件后成功提交了计算。

非常感谢老师!顺便请教一下,对于硅,石英,氧化铝等原子晶体,是否需要使用 ionic Crystal-QMMM呢?manual上面说ionic Crystal-QMMM is for semiconductor and insulators,我不是很确定
sobereva 发表于 Post on 2023-7-27 21:03:20
删了gbw或者加上noautostart

用ORCA当做簇模型时记得对边界用氢进行饱和,别直接计算。

另外,CP2K可以直接对晶体直接做EPR计算,很好用,北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)的“电子g因子与超精细耦合的计算”部分有专门的例子。
wzkchem5 发表于 Post on 2023-7-27 20:48:05
做计算最忌讳的就是不看、不分析报错信息。
根据这两行,你应该能自己推断出发生了什么事情:
The File: Al_Silica_EPR.gbw exists
The file does not contain orbitals

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