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同学您好,您的脚本做的非常有用。但好像不太适合我用超算算出来的log文件后转变的后缀out文件,搜索HF后第一个地方并不像example里的数值,在我的out文件里最后一个HF才是正确数值,所以想问问这种情况应该如何解决,因为exe无法正确读取sp.out文件。“三、如果没有 MP2= 而有 HF= 则读取 HF= 后面的值(对应使用普通泛函和 HF 计算的情况)。通过循环将读取到的每个输出文件能量存储在一个有顺序的容器中,方便 Shermo 之后调用。”想知道怎么样才能设置为搜索out文件中的最后一个HF然后读取数值呢?谢谢老师! |
ncepu-stt 发表于 2025-1-7 23:33 我这边是将easy-shermozhe这个文件夹中的setting.int文件它的名字改了,文件内容根据自己需求调整。我感觉是命名冲突了导致不运行。C:\Users\10593\Desktop\屏幕截图 2025-01-09 123315.jpg |
屏幕截图 2025-01-09 123315.jpg (239.61 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)
manying 发表于 2024-11-10 21:56 您好,我想问一下,您具体是怎么修改呢?能否出一个教程呢?本人不太懂编程,所以想咨询以下 |
kimariyb 发表于 2024-12-22 17:19 是高斯算的单点,setting里 的spFile也正确设置了 |
sai77 发表于 2024-12-16 19:53 你是用高斯算的单点吗?可能是需要修改文件夹中的 settings.ini 中的 spFile,将其设置为 1。不过负责高斯部分的代码也有可能有bug,我目前只能保证用 Orca 的 out 文件是没问题的 |
本帖最后由 sai77 于 2024-12-16 19:59 编辑 请问一下,我这里怎么显示无法读取能量? 用附件里example里的文件可以正常运行,用我自己的文件就提示无法找到能量?单点是普通泛函算的,图3截取了结束部分的信息,有HF部分的数据。 用了1.3.0的EasyShermo和Shermo_2.6也是同样的报错信息。 多谢。 |
kimariyb 发表于 2024-11-9 22:22 楼主编写的脚本没有问题,本人的电脑问题居多。后续经过自己尝试发现是easyShermo中的setting.ini文件与Shermo_2.6中的setting.ini,名字冲突,导致无法调用Shermo,自己改了easyShermo中的setting.ini文件名字,以及easyShermo.py中的相关部分就可以实现调用且速度很快。非常感谢楼主分享 |
202411102156081379..png (158.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)
manying 发表于 2024-11-9 15:42 尝试用 github 里 release 中的试试,帖子中的版本比较老了,没有更新上去。我个人平常用的是 Shermo2.6 和 release 中的可执行文件。如果是 ORCA 单点加 Gaussian 优化是没问题的。一次性处理 20 几个数据也很方便。 |
本帖最后由 manying 于 2024-11-9 16:13 编辑 我这使用2.6版本的Shermo软件,自己使用单个文件计算时可以正常使用,并且也可以在其文件夹中运行Shermo命令。在使用批量计算脚本却无法调用Shermo软件不知该如何解决 |
屏幕截图 2024-11-09 154122.jpg (234.86 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)
🐮的,膜拜 |
alonewolfyang 发表于 2023-8-28 14:14 2.3.6 和最新的 2.4 版本应该都可以用,写这个脚本的时候用的是 2.3.6 版本 |
本帖最后由 alonewolfyang 于 2023-8-28 15:08 编辑 有点愚蠢的经历,才发现Shermo必须为最新版的才能用 ![]() |
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