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Multiwfn+VMD绘制静电势图,为什么做出来的图和标尺都对应正的?

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qyl
发布时间: 2023-8-1 16:09

正文摘要:

想咨询一下,使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势图时,红色部分对应的电负性为负,为什么做出来的图和标尺都对应正的?把colorscale 里面的method改为RWB,分子中电负性为负的那一部分标尺显示仍然是正,是哪里的设置 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-8-1 17:23:07
qyl 发表于 2023-8-1 17:00
谢谢老师纠正,我下次注意。根据分子结构,红色那一步部分的结构,其静电势应该是负的,但用VMD默认的col ...

直接用下文的方法绘制的情况,色彩刻度默认用的BWR,蓝色必然对应负值。
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva.com/443http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html
检查graphics - colors里当前用的color scale。如果VMD里设置没错,那就是你载入的静电势格点数据本身有问题,诸如用的是某些程序的Hartree势
qyl 发表于 Post on 2023-8-1 17:00:04
sobereva 发表于 2023-8-1 16:27
色彩刻度轴体现的是静电势,而不是电负性,搞清楚画的是什么

明明色彩刻度轴正负部分都有,颜色也是红蓝 ...

谢谢老师纠正,我下次注意。根据分子结构,红色那一步部分的结构,其静电势应该是负的,但用VMD默认的colorscale 里的method选项,画出来的那一部分表示的静电势是正的
sobereva 发表于 Post on 2023-8-1 16:27:27
色彩刻度轴体现的是静电势,而不是电负性,搞清楚画的是什么

明明色彩刻度轴正负部分都有,颜色也是红蓝都有,何来“做出来的图和标尺都对应正的”
sobereva 发表于 Post on 2023-8-1 16:12:06
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “Multiwfn+VMD快速地绘制静电势图” 改了,以后务必注意,下次将删帖+扣分处理

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