呀芽芽 发表于 2023-11-28 16:22 解决啦 |
stecue 发表于 2017-5-19 01:14 大佬您好，我打开Tk console，ls了以后发现atmlab.tcl不在当前目录下，想来也肯定不在，因为我不知道该怎么在VMD里通过卢老师说的atmlab.tcl来显示原子编号。想请教一下该怎么写在vmrc里呢？怎么先运行这个脚本呢？求大佬不吝赐教。 |
| 请问VMD可以显示单键、双键等形式吗？ |
sobereva 发表于 2019-1-9 00:04 好的，谢谢sob老师的解答。 |
a815648905 发表于 2019-1-8 20:07 看此文关于depth cueing的说明 用Multiwfn+VMD做RDG分析时的一些要点和常见问题 http://sobereva.com/291（http://bbs.keinsci.com/thread-1206-1-1.html） |
sobereva 发表于 2016-8-16 19:43 老师，请问一下VMD设置成白背景之后，整个界面原子及等值面上有点泛白，没有像您做的图那样颜色鲜亮，请问您知道是什么原因吗？非常感谢 |
stecue 发表于 2017-5-19 01:14 好，非常感谢~ |
guoy14iccas 发表于 2017-5-18 22:41 如果没有写在vmrc里面，那你必须先运行这个脚本。最好打开Tk console，ls一下看看那个文件在不在当前目录下。在的话play atmlab.tcl或者source atmlab.tcl之后就可以用了。 |
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sobereva 发表于 2016-8-15 12:33 sob老师，按照你的指示把atmlab.tcl 拷贝到VMD下。之后在命令行输入字母l，会出现下面的提示，然后输入name并没有显示出序号。想请问您，您写的这个tcl应该没有版本的限制吧，我这个不是最新版本的VMD。我打开的是14400个原子gro文件。不知道是否有问题。？非常感谢您。 |
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| Sob老师，请问如何实现在同一个representation里选定两个元素，并调节为不同颜色呢？比如我在同一个representation先选定C元素后，通过coloring method colorId选择银色颜色，如果接下来在同一个representation selected atom 中增加H元素，H的元素选定白色，此时C也变为白色了。 |
dashuo 发表于 2016-8-24 19:52 不清楚你具体怎么设定的 同一个representation里把H和C同时包括，这个representation才会也包括C-H键。 |
dashuo 发表于 2016-8-24 12:03 你把键的半径设粗点，覆盖原先的representation就行了 |
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