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求助,关于gromacs续跑问题

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发布时间: 2023-8-18 12:33

正文摘要:

求助,请问各位大佬,关于gromacs的续跑问题 在跑完md1的基础上,想再跑5ns,可以不用上述方法, gmx grompp -f md2.mdp -c md1.gro -r md1.gro -p one.top -n one.ndx -o md2.tpr gmx mdrun -v -deffnm md2 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-11-29 00:10:20
CharlesN 发表于 2023-11-28 10:49
还有个问题sob老师 我这样反复启动md模拟 会不会跑到最后发现跑乱套了呀 我是不是需要断点看一下模 ...

自己搞清楚命令的用法和逻辑自然就不会
CharlesN 发表于 Post on 2023-11-28 10:49:46
sobereva 发表于 2023-8-18 15:24
严格精确续跑必须结合cpt文件

还有个问题sob老师 我这样反复启动md模拟 会不会跑到最后发现跑乱套了呀 我是不是需要断点看一下模拟的结果  
非好汉 发表于 Post on 2023-8-18 16:17:25
sobereva 发表于 2023-8-18 15:24
严格精确续跑必须结合cpt文件

好的,谢谢老师
sobereva 发表于 Post on 2023-8-18 15:24:42
严格精确续跑必须结合cpt文件

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