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Gaussian做ts时搜索的过渡态是产物结构 不是过渡态结构 并且出现不收敛问题

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发布时间: 2023-8-19 22:39

正文摘要:

本帖最后由 Zyyyy 于 2023-8-19 23:06 编辑 在做一条反应路径,有两个过渡态,第一步计算的很好 IRC跑出来很光滑 然后我使用IRC结果的产物 作为下一步TS计算初始构型,并做了一点构型上的调整 更趋向于发生反应 ...

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ddddnight 发表于 Post on 2023-9-22 17:54:27
wzkchem5 发表于 2023-9-22 16:00
也要加。这里有两个额外因素:(1)结构优化所需的精度不如单点能所需精度高,导致加弥散的必要性降低; ...

好的老师,谢谢您
wzkchem5 发表于 Post on 2023-9-22 16:00:31
ddddnight 发表于 2023-9-22 03:44
老师,看到您回答的,结合卢老师关于是否加弥散函数的博文,对于这种含有带负电比较多的O的体系,算过渡 ...

也要加。这里有两个额外因素:(1)结构优化所需的精度不如单点能所需精度高,导致加弥散的必要性降低;(2)结构优化用的基组比较小,同等条件下小基组对弥散函数的需求比大基组大,导致加弥散的必要性增加。总的来说,结构优化加弥散的必要性和单点能不会有太大差别
ddddnight 发表于 Post on 2023-9-22 10:44:07
wzkchem5 发表于 2023-8-19 23:56
建议对所有氧加弥散函数。首先,羧酸根的两个氧带明显负电,必须加弥散;参与亲核进攻的氧会在进攻过程中带 ...

老师,看到您回答的,结合卢老师关于是否加弥散函数的博文,对于这种含有带负电比较多的O的体系,算过渡态都应该对O加弥散。请问,是不是对于这种体系,简单结构优化的时候要不要对O加弥散函数呢?
wzkchem5 发表于 Post on 2023-8-19 23:56:50
建议对所有氧加弥散函数。首先,羧酸根的两个氧带明显负电,必须加弥散;参与亲核进攻的氧会在进攻过程中带有一些负电,即便没有生成游离的醇负离子,也可以预期负电会比较多,所以最好也加弥散;酯的羰基氧在亲核进攻过程中会生成四面体中间体的结构(实际未必是一个中间体,也可能在IRC的坡上,而非一个驻点),也会带明显负电,所以也要加弥散;最后剩下那个氧自始至终都不带明显负电,但产物的碳酸酯结构里的两个五元环氧几乎等价,已经有一个五元环氧加了弥散的话,另一个不加会导致高估两个氧的不等价性,所以最好也加弥散。
解决这个问题以后,如果仍然找不到过渡态,应当考虑第二步亲核进攻和第一步是协同异步反应的可能性,方法是IRC跑出来的中间体先不要急着用来找过渡态,而是做opt优化到收敛,如果自动变成了最终产物,就说明第二步没有单独的过渡态

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