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过渡态TS的IRC扫描，峰比较尖咋回事呢？

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lao7

发布时间: 2023-8-23 21:40

正文摘要:

本帖最后由 lao7 于 2023-8-23 22:56 编辑做一个磷酸二脂键（P-O-C）形成的过渡态计算（TS1）。计算完成后，针对过渡态（对应峰突变的一帧对应的状态）进行了IRC扫描（前后200步，步长为10）。IRC扫描观察分子前 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-8-24 04:30:17

IRC和扫描是两码事
“过渡态的峰值对应一帧的分子结构”语义不明，跑IRC应当用过渡态优化任务的最终结构
并且为保险起见，IRC任务加上guess=read读取chk任务收敛的波函数

相关注意事项：
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400（http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html）

dnlx 发表于 Post on 2023-8-24 01:01:37

电子能垒60 kcal/mol太高，何况B3LYP倾向于低估能垒。
说明即使找到了过渡态，也与真实反应无关。查资料，可能是酸碱催化反应，并且并非单步反应。

wzkchem5 发表于 Post on 2023-8-23 23:08:44

IRC曲线里面，过渡态附近的结构有大幅突变吗？

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