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如何获得与受体结合的配体小分子的rotamer library

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发布时间: 2016-8-25 09:22

正文摘要:

我阅读了sob老师的《使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索》后,受益匪浅。有以下问题想请教一下大家,谢谢: 如图所示的小分子配体(黄色)深入结合到了受体蛋白疏水腔空洞中,我想改造配体周围的氨基酸 ...

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sobereva 发表于 Post on 2016-8-25 11:51:59
你这体系不大,直接用molclus里的gentor挨个对可旋转的二面角扫描并优化即可,之后用isostat去掉重复结构。

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