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1）“rms first !@CA.C.O,N,H”：用侧链做rms，是有什么讲究吗？ 2）可以先别写循环，先算:1侧链和:2侧链的质心距离，看看有没有问题，排除一些可能； 3）“for i=1;i<=num;i++”：我猜是num没有指定，所以报错；参考AMBER manual中cpptraj关于for的写法；实在不行可以在外部写循环； |
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