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求助,关于tau_t对模拟的影响

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发布时间: 2023-9-7 10:46

正文摘要:

请问各位大佬,我在进行npt时,tau_t设为0.2或0.5时,不会生成npt.gro、npt.cpt等文件,且使用vmd看npt.xtc动画时只有几帧,npt文件和报错如下图;但是tau_t设为0.8时,不会报错,能正常进行npt。请问这可以不用管报 ...

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非好汉 发表于 Post on 2023-9-8 16:07:21
sobereva 发表于 2023-9-8 00:42
http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8里有相关讨论
倘若你确保拓扑文件、参数、设置都没问题的话,可能初 ...

好的,谢谢老师
sobereva 发表于 Post on 2023-9-8 00:42:20
http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8里有相关讨论
倘若你确保拓扑文件、参数、设置都没问题的话,可能初始结构较糟糕,可以tau_t = 0.8跑一阵子,等体系接近平衡了,再用常用的0.5续跑。tau_t和tau_p没直接关联

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