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思路请教,聚合物分子链解离能计算

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发布时间: 2023-9-7 17:05

正文摘要:

各位老师好,我正在计算有机聚合物分子链的解离能,有机物单体的结构为图中的红色区域,我计算了两个单体,计算步骤如下: 1. 分别在b3lyp/6-31g(d,p)下对分子整体和断键的两个部分进行opt和freq计算,计算得 ...

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wzkchem5 发表于 Post on 2023-9-8 20:20:06
wildon 发表于 2023-9-8 09:20
谢谢老师,请问如果想算激发态分子的键解离能,应该按什么思路进行

和基态的计算方法一样,但(1)激发态的结构优化用TDDFT,可以考虑打开TDA;(2)激发态的单点能计算可以考虑用DLPNO-STEOM-CCSD等方法;(3)结构优化选择的泛函需要适合描述你的激发态;(4)如果同一篇文章既研究基态键能又研究激发态键能,那么泛函必须一致,且主要以激发态为选择泛函的基准,因为基态容易算准而激发态不容易算准;(5)需要知道解离后的自由基处于基态还是激发态,如果是激发态的话是第几激发态
wildon 发表于 Post on 2023-9-8 16:20:42
wzkchem5 发表于 2023-9-8 15:44
可以,不过建议用PCM等溶剂模型,如果用SMD的话,你的聚合物的非极性参数未必和二乙胺可比

谢谢老师,请问如果想算激发态分子的键解离能,应该按什么思路进行
wzkchem5 发表于 Post on 2023-9-8 15:44:21
wildon 发表于 2023-9-8 02:43
老师,请问我研究的聚合物体系的介电常数在3.5-3.7间,我选择DiEthylAmine: 介电常数=3.5766作为溶剂可行 ...

可以,不过建议用PCM等溶剂模型,如果用SMD的话,你的聚合物的非极性参数未必和二乙胺可比
wildon 发表于 Post on 2023-9-8 09:43:52
wzkchem5 发表于 2023-9-7 17:43
严格的做法是用QM/MM,一条链近似成二聚体且用QM描述,其他链用MM描述
稍微不那么严格的做法是选一种和 ...

老师,请问我研究的聚合物体系的介电常数在3.5-3.7间,我选择DiEthylAmine: 介电常数=3.5766作为溶剂可行吗
wildon 发表于 Post on 2023-9-7 17:47:45
wzkchem5 发表于 2023-9-7 17:43
严格的做法是用QM/MM,一条链近似成二聚体且用QM描述,其他链用MM描述
稍微不那么严格的做法是选一种和 ...

好的,谢谢老师,我来试试
wzkchem5 发表于 Post on 2023-9-7 17:43:39
wildon 发表于 2023-9-7 10:39
谢谢老师,请问应该如何考虑旁边的其他链的影响,我的是一个固体材料。

严格的做法是用QM/MM,一条链近似成二聚体且用QM描述,其他链用MM描述
稍微不那么严格的做法是选一种和你的聚合物链的极性类似的溶剂,加隐式溶剂模型算
wildon 发表于 Post on 2023-9-7 17:41:03
ZZU_SCU 发表于 2023-9-7 17:37
聚合物聚合度高。电子效应影响很大,封端后形成的酰胺键影响断裂酰胺键更真实,更符合真实情况。况且pa6 ...

好的,谢谢啦
wildon 发表于 Post on 2023-9-7 17:39:57
wzkchem5 发表于 2023-9-7 17:30
问题不大,主要问题是这样算出来的是气相的解离能,而你的实验估计不是气相里的。最好能至少用隐式溶剂模型 ...

谢谢老师,请问应该如何考虑旁边的其他链的影响,我的是一个固体材料。
ZZU_SCU 发表于 Post on 2023-9-7 17:37:33
wildon 发表于 2023-9-7 17:25
对,pa6,请问为什么要这样做

聚合物聚合度高。电子效应影响很大,封端后形成的酰胺键影响断裂酰胺键更真实,更符合真实情况。况且pa6两端可能是羧基、氨基,不可能是醛基吧。
wzkchem5 发表于 Post on 2023-9-7 17:30:13
问题不大,主要问题是这样算出来的是气相的解离能,而你的实验估计不是气相里的。最好能至少用隐式溶剂模型描述环境(旁边的其他链或者溶剂分子)的影响。链的构象对BDE也有贡献,但是估计不如旁边其他链或者溶剂影响大。此外可以考虑用DLPNO-CCSD(T)算单点能,相应地结构优化的基组也可以稍微大一点。
二聚体的结论可以适用于多聚体,因为至少对于普通有机分子而言,键解离能是很局域的性质,不受离键很远的地方的影响。
wildon 发表于 Post on 2023-9-7 17:25:26
ZZU_SCU 发表于 2023-9-7 17:24
尼龙6嘛,建议左边用乙酸封端,右边用甲胺封端

对,pa6,请问为什么要这样做
ZZU_SCU 发表于 Post on 2023-9-7 17:24:10
尼龙6嘛,建议左边用乙酸封端,右边用甲胺封端

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