求助 gromacs计算乙二醇聚乙烯醇（PVA）不能正常溶于水

查看数: 1804 | 评论数: 5 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2023-9-9 16:49

各位老师大佬们好。gromacs初学者，想模拟一下氯化锌（ZnCl2）溶于水-乙二醇-PVA的混合溶液在电场下锌离子和氯离子的扩散过程。在AMBER力场下建立了20*20*20（nm）的盒子，并对其先进行nvt（0.2ns）、再进行npt（1ns ...

回复 Reply

Rsen 发表于 Post on 2024-8-30 15:04:40

我做实验的时候就发现PVA不能很好的溶解在水/乙二醇溶液里，会有团聚现象

Permanence 发表于 Post on 2023-11-29 15:47:02

秋白纳发表于 2023-11-21 14:42
你好我想请教一下你的水和乙二醇的混合体系是怎么准备的呀？是先把乙二醇当做溶质，溶解到水里吗？

packmol 添加的

秋白纳 发表于 Post on 2023-11-21 14:42:41

Permanence 发表于 2023-9-13 12:34
老师您好，我现在把体系换成了仅有乙二醇和水的体系，在NVT下又跑了3ns，这两种物质也存在着聚一起的现象， ...

你好我想请教一下你的水和乙二醇的混合体系是怎么准备的呀？是先把乙二醇当做溶质，溶解到水里吗？

sobereva 发表于 Post on 2023-9-9 22:13:50

跟退火没关系。NVT最终都足够分散了

可能参数不合理。在此之前先尝试在NVT下继续跑1ns，看会变成什么样

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register