计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

vmd导出的蛋白质二级结构图如何编辑,或者转化

查看数: 1713 | 评论数: 1 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2023-9-9 19:09

正文摘要:

我用VMD导出了蛋白质的二级结构图,且图片是eps格式,该如何修改横纵坐标呀或者转换成后面这种类型的图片

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2023-9-9 22:21:56
让此插件导出原始数据,然后自己写程序整理成想要的形式

也可以参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)讲VMD脚本编写的此页ppt里的脚本,可给对当前帧计算各种二级结构残基数及比例。外面套个对所有帧的循环和统计命令就能实现。


手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 00:56 , Processed in 0.188226 second(s), 31 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list