sobereva 发表于 2023-9-27 04:01 谢谢老师，这就按您说的去计算。 |
wzkchem5 发表于 2023-9-27 00:48 谢谢解答，按您说的去试试。 |
无名ovo 发表于 2023-9-26 21:08 正经做计算的人基本没有直接从opt freq任务里读取热力学量的，都是相对便宜级别的热力校正量和高精度单点能相加来得到 参考北京科音基础量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html）的ppt 
|
本帖最后由 wzkchem5 于 2023-9-26 17:49 编辑 无名ovo 发表于 2023-9-26 14:08 试一下做显式溶剂化。尤其是氢氧根，和水有强氢键，隐式溶剂模型描述不准，需要至少把和OH-直接形成氢键的水分子画出来。甲酸根同理但必要性次之，甲酸再次之。 参考https://mattermodeling.stackexch ... -molecule/9482#9482 另外一个问题：这个理论级别对于结构优化来说太高了（双杂化泛函/ma-def2-TZVP绰绰有余了），对于单点计算来说太低了（CCSD必须加(T)得到的能量才可靠）。应该把CCSD加到CCSD(T)算单点能 |
sobereva 发表于 2023-9-12 17:34 sob老师，按您说的做了计算，计算结果还是不理想，没有找到问题出在哪里，想向您请教下。 这是具体计算过程和结果： 计算过程：构建反应物产物结构→执行“#p opt freq ccsd/aug-cc-pvtz scrf=(solvent=water)”任务→计算焓变（Sum of electronic and thermal Enthalpies的差值） 计算结果：
| |||||||||||||||||||||||||||||||
wzkchem5 发表于 2023-9-15 15:18 谢谢您的讲解，记住了。 |
无名ovo 发表于 2023-9-13 14:54 ”同一个原子在反应前后的基组必须一致“的优先级比”中性分子不加弥散“的优先级要高，当两者冲突时，应该优先满足前者。例如：计算HCOOH脱质子形成HCOO-，产物的两个O必须加弥散，所以反应物的两个O也必须加弥散（因为需要基组统一），即便反应物是中性分子也必须加。但是如果你整篇文章涉及HCOOH却不涉及HCOOH脱质子的过程，也没有其他加弥散的理由（算极化率等），那一般不用加弥散。 |
|
谢谢老师，明白了，我这就试试。 想向您请教下，想通过Gaussian的频率分析获得的焓数据，用反应前后焓变计算有机化学反应热，不清楚理论上是否可行。 |
无名ovo 发表于 2023-9-13 21:55 这么小的体系，纠结谁加谁不加弥散没意义，都加上就完了 对氢可以做振动分析得到热力学量 |
sobereva 发表于 2023-9-12 17:34 谢谢Sob老师，对阴离子和分子做Opt+Freq基组选择有疑问，“考虑到阴离子（OH-和HCOO-）要加弥散，分子若是加弥散会不会导致计算结果不合理”。 也想向您请教下，想通过Gaussian频率分析获得的H数据计算有机化学反应热，不清楚理论上是否可行。片段化的学习始终有很多困惑。 |
linzz 发表于 2023-9-12 14:14 谢谢，考虑到阴离子（OH-和HCOO-）要加弥散，分子不加弥散。不清楚这样想是否可行。 |
|
这么点体系，直接上CCSD(T)/aug-cc-pVTZ 而且要注意和实验数据的可比性，弄清楚实验测定的条件 同一个原子在不同体系中用的基组必须严格统一，否则能量求差时系统性误差没法抵消 |
| 不能用不同的基组，而且你的基组太小了。可以看看这个。http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 9%B5%C4%D1%A1%D4%F1 |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2024-11-26 14:44 , Processed in 2.087561 second(s), 25 queries , Gzip On.
组图打开中，请稍候......
收藏 Add to favorites