计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

7B13安装VASP6.4.1体验

查看数: 4312 | 评论数: 18 | 收藏 Add to favorites 11
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2023-9-13 09:41

正文摘要:

本帖最后由 fantexi113 于 2023-9-13 09:41 编辑 最近组装了一台3代EPYC,主要用于VASP计算。配置如下: CPU:7B13 主板:技嘉MZ32-AR0 内存:32*8 2666v (超频到3200使用) 硬盘:PM9a3 1.92t 使用了 ...

回复 Reply

fantexi113 发表于 Post on 2023-11-8 10:25:06
本帖最后由 fantexi113 于 2023-11-8 10:27 编辑
fantexi113 发表于 2023-11-8 10:22
参考这个帖子:http://.cn/schemedetails-288.html

S1:  升级linux内核使其更好地支持7742

cn前还有一个词,自动屏蔽了
fantexi113 发表于 Post on 2023-11-8 10:22:42
本帖最后由 fantexi113 于 2023-11-8 10:24 编辑
wypkdhd 发表于 2023-11-7 18:00
请教楼主,“系统建议CentOS 7-2009。CentOS 7记得开启睿频,默认不开启。”这句话实际如何操作?

参考这个帖子:http://.cn/schemedetails-288.html

S1:  升级linux内核使其更好地支持7742

uname -r    #查看内核版本,若内核版本低于4.0则需要进行内核升级

rpm --import https://www.elrepo.org/RPM-GPG-KEY-elrepo.org #导入ELRepo源公共密钥

rpm -Uvh http://www.elrepo.org/elrepo-release-7.0-3.el7.elrepo.noarch.rpm #安装ELRepo源

yum --enablerepo=elrepo-kernel install kernel-ml #安装最新linux内核

grub2-mkconfig -o /boot/grub2/grub.cfg #重建内核启动配置文件

grub2-set-default 0 #设置新安装的内核默认启动(新安装的内核在内核顺序中一般为0)

reboot #重启后用uname -r验证内核是否升级成功



S2:  开启7742睿频

cat /proc/cpuinfo | grep MHz #查看cpu的主频(睿频未开启前,或者内核未升级前,主频处于1500-2500MHz之间)

yum install cpupowerutils #安装cpupower

cpupower  frequency-set -g performance #设置cpu模式为性能模式
wypkdhd 发表于 Post on 2023-11-7 18:00:13
请教楼主,“系统建议CentOS 7-2009。CentOS 7记得开启睿频,默认不开启。”这句话实际如何操作?
wypkdhd 发表于 Post on 2023-11-7 17:59:43
这是神马事 发表于 2023-11-4 09:41
给大家提供一个AOCC+AOCL编译的参考:同样的7b13,用aocc+aocl编译vasp5.4.4,50原子Hg测试,性能比楼主的i ...

我用intel 2019 vasp5.4.4 amd 7543 8核速度和楼主4核速度一样。
这是神马事 发表于 Post on 2023-11-4 09:41:28
给大家提供一个AOCC+AOCL编译的参考:同样的7b13,用aocc+aocl编译vasp5.4.4,50原子Hg测试,性能比楼主的intel慢20%左右,供大家参考
Janus 发表于 Post on 2023-11-2 08:44:22
fantexi113 发表于 2023-10-25 11:47
用的站长50Hg原子测试的,用的incar-long,超线程没关,一直困惑,32以上还变慢了。

4核

LOOP时间太短。建议最低的搞20-30s/LOOP step的任务。太短的时间,计算速度的瓶颈不在CPU那儿

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
zmjsce + 1 我很赞同

查看全部评分 View all ratings

comchem 发表于 Post on 2023-10-25 22:24:26
谢谢分享。
wypkdhd 发表于 Post on 2023-10-25 21:30:20
fantexi113 发表于 2023-10-25 11:47
用的站长50Hg原子测试的,用的incar-long,超线程没关,一直困惑,32以上还变慢了。

4核

收到,万分感谢。
fantexi113 发表于 Post on 2023-10-25 11:51:10
hersvim 发表于 2023-10-22 23:10
米兰不建议用CentOS 7这么老的系统和内核了

用新的系统装Intel_Parallel_Studio_XE_2018_update0老是出问题,所以用CentOS 7了,内核升级到了6.5.2-1.el7.elrepo.x86_64,目前用着还行
fantexi113 发表于 Post on 2023-10-25 11:48:35
1030266769 发表于 2023-10-11 21:36
大佬可以求一下Intel_Parallel_Studio_XE_2018_update0这个编译器嘛,目前试过aocc和aocl安装、spack安装  ...

链接: https://pan.baidu.com/s/1V2jKlogWfVLgHjeqxc0Qiw 提取码: 97x9 复制这段内容后打开百度网盘手机App,操作更方便哦
hersvim 发表于 Post on 2023-10-22 23:10:22
米兰不建议用CentOS 7这么老的系统和内核了
wypkdhd 发表于 Post on 2023-10-11 23:01:34
1030266769 发表于 2023-10-11 21:37
大佬有amd安装vasp的经验嘛,目前试过aocc和aocl安装、spack安装 都失败了也不知道为什么,
可以提 ...

7B13我帖子里有,就按intel的编译方式搞就完事了。
1030266769 发表于 Post on 2023-10-11 21:37:30
wypkdhd 发表于 2023-9-13 12:32
您好,可以了请您帮忙去那个36834帖子里面测试一下你这边编译的最快的方式,在50个Hg原子和我那个NiO的速度 ...

大佬有amd安装vasp的经验嘛,目前试过aocc和aocl安装、spack安装 都失败了也不知道为什么,
可以提供测试 我的服务器是7B13

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 12:16 , Processed in 0.201387 second(s), 27 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list