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求助:gromacs用gmx rdf计算9(r)和配位数

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发布时间: 2023-9-13 19:26

正文摘要:

通过gmx rdf命令分别得到了锂离子周围氧原子的g(r)和配位数(-cn)曲线,在我之前的理解中g(r)曲线的高度大小粗略的可以对应于配位数的大小,但是在我计算的这个体系中却失效了,g(r)图我对比文献,文献里也是遵循g( ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-9-13 23:21:24
g(r)跟配位数完全是两码事,做积分得到的配位数曲线才体现不同r内的配位数。g(r)仅体现r的薄壳层内的被统计粒子的相对密度而已。

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