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求助Molclus操作生成金属团簇

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啊嘞嘞

发布时间: 2023-9-15 11:07

正文摘要:

本帖最后由啊嘞嘞于 2023-9-15 11:09 编辑老师，您好！我按照http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html里边看了关于金属团簇初始结构的搜索，对Lil例子进行操作，但是得不到下图1的结构。生成的traj.xyz ...

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啊嘞嘞 发表于 Post on 2023-9-19 08:45:23

sobereva 发表于 2023-9-18 09:19
可以

谈谈原子间是否成键的判断问题

好的，谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2023-9-18 09:19:50

啊嘞嘞发表于 2023-9-17 11:12
不好意思老师，是我理解错了。老师，我还有两个问题：1.是否可以从获得的cluster.xyz文件取坐标用gaussia ...

可以

谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414（http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html）

sobereva 发表于 Post on 2023-9-16 01:29:10

文本编辑器打开traj.xyz弄清楚里面记录的什么

VMD默认用line方式显示原子和键，如果traj.xyz里的Li之间都超过了VMD成键判断阈值，Li就会显示成一个像素大小的点，不改成CPK等方式的话眼神不好的话看不清楚

又写成g16w，红字怎么强调都没用
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html

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