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Packmol建模时报错:限制设置错误应该怎么解决

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发布时间: 2023-9-15 22:40

正文摘要:

老师,我在对若干个L-P分子、Rhs分子、RS分子、Water分子进行建模时,在用Packmol软件进行插入的时候显示报错: 这是我的inp文件,请问老师应该如何解决这个问题?

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sobereva 发表于 Post on 2024-4-14 03:19:48
姜酱将 发表于 2024-4-14 01:53
请问老师我是先要把不是fixed的结构给packing之后再进行一个packing,把fixed的结构再加进去吗

看不懂你的意思
自己保证当前做的约束设置之间不能有任何冲突的地方
姜酱将 发表于 Post on 2024-4-14 01:53:28
sobereva 发表于 2023-9-16 00:57
把fixed都去掉,参考此文的例子
分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用
http://sobereva.com/473(htt ...

请问老师我是先要把不是fixed的结构给packing之后再进行一个packing,把fixed的结构再加进去吗
ngaoo 发表于 Post on 2023-9-16 14:19:58
sobereva 发表于 2023-9-16 00:57
把fixed都去掉,参考此文的例子
分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用
http://sobereva.com/473(htt ...

问题已经解决,谢谢老师
sobereva 发表于 Post on 2023-9-16 00:57:01
把fixed都去掉,参考此文的例子
分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用
http://sobereva.com/473http://bbs.keinsci.com/thread-12549-1-1.html

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