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求助:使用CP2K计算CI-NEB过渡态碰到的程序报错

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发布时间: 2023-9-16 17:24

正文摘要:

本帖最后由 qq1772733073 于 2023-9-18 16:23 编辑 各位老师好,我最近在使用CP2K计算过渡态时,按照网络上的教学配合卢天老师的multiwfn生成了用于计算过渡态的输入文件,但是最后在进行过渡态计算过渡态时,任 ...

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qq1772733073 发表于 Post on 2023-9-19 09:57:39
丁越 发表于 2023-9-18 20:32
之前没注意这个字段,你用的是cif,换成xyz格式的文件就没问题了

,多谢老师,问题已经解决。
qq1772733073 发表于 Post on 2023-9-19 09:56:19
qq1772733073 发表于 2023-9-18 11:03
老师,我在计算是还生成了一系列2-r-0.out,2-r-1.out,2-r-2.out文件,里面的报错如下,和这个有关系吗?
...

,多谢老师,问题已解决。
丁越 发表于 Post on 2023-9-18 20:32:10
qq1772733073 发表于 2023-9-18 11:03
老师,我在计算是还生成了一系列2-r-0.out,2-r-1.out,2-r-2.out文件,里面的报错如下,和这个有关系吗?
...


之前没注意这个字段,你用的是cif,换成xyz格式的文件就没问题了
qq1772733073 发表于 Post on 2023-9-18 10:35:06
丁越 发表于 2023-9-17 12:27
确保NUMBER_OF_REPLICA * NPROC_REP 的数目小于等于队列最大可调用核数

老师,应该不是这个原因,我们那边服务器队列可调用的最大核数有20×36=720个核,应该是其他原因。
丁越 发表于 Post on 2023-9-17 12:27:39
qq1772733073 发表于 2023-9-17 09:47
老师,我试过把核数与插点数调低,但还是一样的报错

确保NUMBER_OF_REPLICA * NPROC_REP 的数目小于等于队列最大可调用核数
丁越 发表于 Post on 2023-9-16 17:37:03
    NUMBER_OF_REPLICA 5 #The number of replica to use in the BAND
    NPROC_REP 36 #The number of processors to be used per replica
看这两行,分别指定了插点的数目和每个插点所用的核数。你提交时申请调用核数必然超过了队列系统的限制,自然给你杀了。

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