sobereva 发表于 2023-9-21 03:02
没平衡就继续跑平衡就完了。拿都已经平衡的状况对比

好的 老师  我再试一下 谢谢您

Permanence 发表于 2023-9-20 10:52
老师，这个是我做的几个能量随时间变化的曲线，不加PVA后的模型可以分散开，而且能量也相对平衡。但是加PVA ...

没平衡就继续跑平衡就完了。拿都已经平衡的状况对比

sobereva 发表于 2023-9-20 03:33
所谓的能量不平衡不知道你怎么判断的，至少摆个随时间变化的曲线图出来，而且必须跑得时间足够长。大分子扩 ...

是用的 gmx energy 看势能和时间的变化去判断的老师

所谓的能量不平衡不知道你怎么判断的，至少摆个随时间变化的曲线图出来，而且必须跑得时间足够长。大分子扩散本来就慢，就跑个比如1、2ns很可能根本就还没达到平衡，怎么着也应该跑个几十ns看看。