计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

GROMACS能量最小化时出现LINCS Warning

查看数: 1026 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2023-9-19 20:33

正文摘要:

使用GROMACS做磷脂双层膜的能量最小化,运行时出现LINCS WARNING,如下图,并输出对应的pdb文件 请教各位,这是什么原因导致的?对后续模拟有没有影响?

回复 Reply

Yaozhi_Yang 发表于 Post on 2023-9-20 08:49:26
sobereva 发表于 2023-9-20 03:10
仔细看http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8

只是一开始出现,后来不再出现,可以无视。如果一直频繁出 ...

好的,谢谢!
sobereva 发表于 Post on 2023-9-20 03:10:26
仔细看http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8

只是一开始出现,后来不再出现,可以无视。如果一直频繁出现,甚至模拟崩溃,根据以上链接排查和解决

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 23:59 , Processed in 0.186643 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list