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请教:水分子OH键与Z轴夹角的概率问题

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发布时间: 2023-9-25 16:00

正文摘要:

不知道大佬有没有做过这个,我用gromacs模拟水分子的运动体系,模拟后将水分子的运动轨迹文件提取出来,我用python编写计算两个角度,一个是水分子偶极与Z轴夹角,一个是水分子OH键与Z轴夹角。在统计OH键与Z轴夹角出 ...

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对抗路达摩 发表于 Post on 2023-9-29 10:30:19
首先你的采样不平滑,把模拟时间拉长一点,或者把输出轨迹的间隔减小一点,看是否还有一样的问题。

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