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使用newton-x结合gaussian09做 动力学模拟出错

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发布时间: 2016-9-4 17:29

正文摘要:

各位坛友,使用newton-x结合gaussian09做激发态动力学模拟,生成trajectories后,在TRAJ1中运行$NX/moldyn.pl > moldyn.log & 这个命令,计算了一段时间后出错,错误信息见下图,麻烦有经验的社友指点一下该如何 ...

回复 Reply

yuehua 发表于 Post on 2021-11-19 19:56:03
请问具体的解决方法是什么?我也遇到了同样的问题,改了步长和ETOT,结构也没什么问题就是出现的错误还是一样的
archer 发表于 Post on 2021-1-17 20:16:09
旺旺雪饼 发表于 2018-7-8 14:52
最终应该是解决了,但是时间太久了,记不清怎么解决的了。

tutorial里有写,前10条轨迹都会报错
In this case study, all the 10 trajectories finished in error.
archer 发表于 Post on 2021-1-17 20:15:11
Amiswen 发表于 2018-7-10 21:26
我遇到同样的问题,还没解决呢,尝试了1和3,Etot_drift不知道怎么去改

在TRAJXX路径下的control.dyn加入Etot_drift参数,默认值为0.5 eV,具体可含义查看官方的document:
ETOT_JUMP
= [0.5]
Kill trajectory if total energy deviate more than ETOT_JUMP eV in one time step.
ETOT_DRIFT
= [0.5]
Kill trajectory if total energy deviate more than ETOT_DRIFT (eV) in comparison to the value in t = 0.
Amiswen 发表于 Post on 2018-7-10 21:26:39
旺旺雪饼 发表于 2018-7-8 14:52
最终应该是解决了,但是时间太久了,记不清怎么解决的了。

我遇到同样的问题,还没解决呢,尝试了1和3,Etot_drift不知道怎么去改
旺旺雪饼 发表于 Post on 2018-7-8 14:52:07
Amiswen 发表于 2018-6-21 15:00
最终解决了吗,也遇到了这个问题

最终应该是解决了,但是时间太久了,记不清怎么解决的了。
Amiswen 发表于 Post on 2018-6-21 15:00:36
最终解决了吗,也遇到了这个问题
旺旺雪饼 发表于 Post on 2016-10-9 08:41:48
遗忘爱神 发表于 2016-10-8 23:30
但是教程中提出来的问题(Etot_drift和步长),你最后是怎么解决的呢?

减小dt,增加Etot_drift都试了,没能解决,现在还不知道为什么
遗忘爱神 发表于 Post on 2016-10-8 23:30:30
旺旺雪饼 发表于 2016-10-8 22:11
我也只得到了三十多个,只要文件里面的东西跟教程一样就行

但是教程中提出来的问题(Etot_drift和步长),你最后是怎么解决的呢?
旺旺雪饼 发表于 Post on 2016-10-8 22:11:02
遗忘爱神 发表于 2016-10-8 20:15
不一样啊,我只能得到19个文件,根本得不到教程说的190多。

我也只得到了三十多个,只要文件里面的东西跟教程一样就行
遗忘爱神 发表于 Post on 2016-10-8 20:15:45
旺旺雪饼 发表于 2016-10-8 17:39
可能trajectories生成有问题,你得到的trajectories文件跟教程里的一样吗?

不一样啊,我只能得到19个文件,根本得不到教程说的190多。
旺旺雪饼 发表于 Post on 2016-10-8 17:39:15
遗忘爱神 发表于 2016-10-5 16:50
运行$NX/moldyn.pl > moldyn.log &根本没有反应是什么原因呢?

可能trajectories生成有问题,你得到的trajectories文件跟教程里的一样吗?
遗忘爱神 发表于 Post on 2016-10-5 16:50:26
运行$NX/moldyn.pl > moldyn.log &根本没有反应是什么原因呢?
旺旺雪饼 发表于 Post on 2016-9-7 09:27:12
sobereva 发表于 2016-9-7 05:40
这属于小众向程序,小众向程序建议直接问作者

给作者发过好多次邮件了,从没收到过回复。。。。。
sobereva 发表于 Post on 2016-9-7 05:40:10
旺旺雪饼 发表于 2016-9-6 21:59
减小模拟步长我已经试过了,还是一样的错误。

计算级别已经足够了,跟手册要求的一样,结构是噻吩环, ...

这属于小众向程序,小众向程序建议直接问作者

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