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求助:使用cp2k优化氧化铝负载Cu13团簇后,团簇有些散

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发布时间: 2023-9-26 11:46

正文摘要:

本帖最后由 卡卡西永恒 于 2023-10-14 22:46 编辑 我在Multiwfn中创建cp2k输入文件,设置任务优化结构(晶胞尺寸不变),设置XY周期性,设置色散校正DFT-D3(BJ),开启smearing,固定下面两层原子,其他参数默认。计 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-9-29 05:49:48
卡卡西永恒 发表于 2023-9-28 21:10
sob老师,我现在试着对结构优化后的Cu13团簇计算单点能,在Multiwfn中设置开启smearing,基组设置Ahlrich ...

用杂化泛函时,要么把Multiwfn自动产生的输入文件里SCREEN_ON_INITIAL_P T注释掉,要么读取纯泛函的波函数文件当初猜,否则几乎不可能收敛。这是常识性知识
下文也说了
解决CP2K中SCF不收敛的方法
http://sobereva.com/665http://bbs.keinsci.com/thread-37196-1-1.html
北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里我讲课时也强调了
卡卡西永恒 发表于 Post on 2023-9-28 21:10:31
sobereva 发表于 2023-9-28 05:50
1 是
2 如果研究结合整个过程能量变化,单体也必须进行优化
3 同种原子(诸如都是Cu13的部分)的基组必 ...

sob老师,我现在试着对结构优化后的Cu13团簇计算单点能,在Multiwfn中设置开启smearing,基组设置Ahlrichs-def2-TZVP,设置理论方法为PBE0,其他默认。计算过程中convergence的值维持在三点多不收敛。我又把基组和理论方法改为了默认的,在计算128步后也没有收敛,后来增加到了300步和500步后也是没收敛。请问老师我的设置有没有哪里明显不合理的地方

Cu13结构优化时具体为设置任务优化原子和坐标(晶胞尺寸不变),开启smearing,其他参数默认,刚开始128步内未收敛,后面都成功收敛。

Cu13.inp

3.89 KB, 下载次数 Times of downloads: 14

结构优化输入文件

Cu13.out

196.68 KB, 下载次数 Times of downloads: 6

结构优化输出文件

Cu13-energy.inp

3.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

默认基组单点能输入文件

Cu13-energy.out

50.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

默认基组单点能输出文件

Cu13-energy-2.inp

3.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 6

def2-TZVP基组单点能输入文件

Cu13-energy-2.out

38.15 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

def2-TZVP基组单点能输出文件

sobereva 发表于 Post on 2023-9-28 05:50:33
卡卡西永恒 发表于 2023-9-27 13:33
sob老师,在优化完结构之后我要用cp2k计算Cu13团簇在γ-Al2O3表面的吸附能,关于计算吸附能有几个问题请 ...

1 是
2 如果研究结合整个过程能量变化,单体也必须进行优化
3 同种原子(诸如都是Cu13的部分)的基组必须一致,不同种的不需要一致
DZVP-MOLOPT-SR-GTH适合做优化,算能量太low
4 冻结显然不影响单点能的计算
周期性该怎么设还怎么设,跟你算单点还是优化没关系
卡卡西永恒 发表于 Post on 2023-9-27 13:33:45
sobereva 发表于 2023-9-26 14:44
输入文件本身没明显问题。结果也没必然问题,虽然也可以尝试Cu13一开始摆远点再看看结果
不用管warning

sob老师,在优化完结构之后我要用cp2k计算Cu13团簇在γ-Al2O3表面的吸附能,关于计算吸附能有几个问题请教您

(1)计算公式为E=Eab-Ea-Eb,其中a,b分别代表Cu13团簇和γ-Al2O3,这个计算方法是正确的吧

(2)在计算单独的Cu团簇和γAl2O3能量的时候,我是用之前单独优化后的模型算,还是说我优化完Cu13/γAl2O3整体后,再分别将Cu13和γ-Al2O3摘出来算。(因为整体优化完后对比之前单独优化Cu13和Al2O3有轻微结构差别)

(3)在计算Eab、Ea、Eb时,所使用的基组是不是要保持一致呀,我可以都使用DZVP-MOLOPT-SR-GTH吗

(4)在计算能量时,还需要冻结原子、设置XY方向周期性这些操作吗
sobereva 发表于 Post on 2023-9-26 14:44:01
输入文件本身没明显问题。结果也没必然问题,虽然也可以尝试Cu13一开始摆远点再看看结果
不用管warning

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