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高斯优化柔性扫描寻找过渡态时取哪个点进行优化?

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发布时间: 2023-9-30 21:41

正文摘要:

各位老师,我想请教一个问题,我想用柔性扫描辅助寻找过渡态,中间的氧进攻钼,与它形成桥氧键的同时有一个水分子脱去。发现扫描出来的图是这样子,我有两个问题: 1、那我做下一步TS优化是选最高点还是最高点右边 ...

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abcd401 发表于 Post on 2023-10-1 20:18:58
wzkchem5 发表于 2023-10-1 03:44
当扫描曲线光滑时,扫描最高点一般离过渡态最近,适合作为过渡态初猜。但你的扫描曲线不光滑,这时有两种做 ...

好的谢谢老师!我试一下您这个做法
wzkchem5 发表于 Post on 2023-10-1 03:44:29
当扫描曲线光滑时,扫描最高点一般离过渡态最近,适合作为过渡态初猜。但你的扫描曲线不光滑,这时有两种做法:(1)通过改变扫描方向或选择其他扫描坐标,试图扫出光滑的曲线,再取最高点结构,缺点是需要多做一次扫描;(2)直接取现有曲线的最高点,这样做收敛概率会比较低,但好处是省一次扫描。最高点右边那个点没有理由比最高点更像过渡态,如果你从2~2.9埃的曲线趋势判断过渡态键长应该出在3.1埃附近的话,正确做法是从2.9埃反向续扫到3.1埃,而不是取你已有扫描曲线上的3.1埃的结构。
虚频振动方向是什么,只有优化出来过渡态才能知道

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