AMD 9654 单路 vs Intel 8369B双路
也就是AMD 96核心 vs Intel 64核心。

网友提供的算例。 告知需要6小时以上。
我问使用，grep LOOP OUTPUT评估一下可否，对方不认可这种比对。

那只好放在集群上排队等着计算。

采用标准编译， 在慧计算的机器上， 64核心跑同样的算例， 4小时40分钟不到。 SLURM调度器。
经过慧计算调优后， 同样算例， 64核心跑， 大概2小时20分钟。 SLURM调度器。

慧计算采用Intel工具链编译。

并非表达： AMD好或者Intel好； 而是想说明，如果编译不当，使用不当，计算效率可能差很多。

一般而言， 处理器更新换代，性能提升100%比较少见。
但是使用不当，导致性能掉一两倍，那岂不是花了大价钱，而实际性能，确实古董级的电子垃圾？

另， 本人不懂VASP，看不懂输入文件在跑什么东西。

相关讨论截图如下。

老师，个人一手自用，7950X+3080(10 G)算VASP速度怎么样？体系一般都是在100个原子以内，偶尔用到分子动力学模拟，不想配服务器主机，主要是跑计算的过程中可以偶尔看看网站，写写论文之类的

Entropy.S.I 发表于 2024-2-14 21:12
首先更新系统，内核越新越好。新的硬件搭配新的Linux内核才能发挥出更好的性能，特别是Zen4新增了扩展指 ...

熵大，我也注意到小黄鱼上的V100 SXM2的性价比逐渐凸显出来，当然，缺点是电费感人。你能不能细说一下，4卡V100 SXM2跑DFT和AIMD时，体系的上限。还有跑CP2K怎么样。这套机器跑双精度LAMMPS也应该不错吧。期待你的文章。

Weldingspock 发表于 2024-2-14 10:48
我用aocc+aocl编译的vasp.6.4.2比 intel oneapi编译的速度只快了5%左右。系统是Cent os 8，gnu版本是8.3.1 ...

首先更新系统，内核越新越好。新的硬件搭配新的Linux内核才能发挥出更好的性能，特别是Zen4新增了扩展指令集。现在Ubuntu Server 22.04 LTS的HWE内核已经是6.5了。

然后仔细测试不同的NCORE、NPAR、KPAR等参数。

不过目前已经不推荐用CPU跑VASP了，用2.4万元组装一台2*4卡V100 SXM2的机器，单个4卡模组跑480原子pure DFT的速度是双路8383C的2.5倍，8卡并行跑一个Cd33Te32 Hybrid DFT速度是双路9654的6倍。年前我就已经做了大量测试，目前准备定制专用机箱以便把这套方案普及开，浅浅颠覆一下计算材料学领域。

我用aocc+aocl编译的vasp.6.4.2比 intel oneapi编译的速度只快了5%左右。系统是Cent os 8，gnu版本是8.3.1，cpu是amd 9554。openmpi版本是4.1.6。最后运行vasp的命令直接是mpirun -np ** vasp_std。请问最后的运行命令需要改吗还是有一些别的参数需要修改？

ggdh 发表于 2023-12-27 16:41
请问9654上最终选用的是96核X2并行 ，而没有选用平方数的原因是因为96x2 更快么

对。如果用平方数（64*3），没法map by l3cache，核间延迟成为了瓶颈。24Q2发布EPYC Turin，classic版本单机256核就不会有这种头疼的问题了

请问9654上最终选用的是96核X2并行 ，而没有选用平方数的原因是因为96x2 更快么

Entropy.S.I 发表于 2023-10-12 02:58
3年后Zen6将会引入硅中介层或EMIB封装技术，巨幅改善CCX之间互联性能（参考Intel SPR开始所用的EMIB，核 ...

口水ing
想想一台机器512核就相当于一套超算了
不知道能快多少

不过最期待的还是像MD在gpu上那样几十倍的涨

我发现了一个问题，在zen3和zen4上设OMP_PLACES或OMP_PROC_BIND后，某些情况跑起来会慢几百倍。unset这两个环境变量后就正常了，具体出现条件还没有研究。用的是标准的toolchain编译的 cp2k/2023.2-openmpi416-gcc113

Janus 发表于 2023-12-3 01:38
我相信很多朋友对这个贴子有错误的认识，只看那几个计算和CPU纸面信息，越看越糊涂，特做此回复。仅代表个 ...

非常感谢大佬！心里有数了。论坛需要你这样热心且有实力的大佬，比某位只会骂别人intel信徒的好多了

我相信很多朋友对这个贴子有错误的认识，只看那几个计算和CPU纸面信息，越看越糊涂，特做此回复。仅代表个人观点，仅代表个人观点！不喜勿看，不喜勿喷：
双路9654，涉及复杂的调优，对体系小但任务数量多的用户，请租机时测试。淘宝闲鱼上均有机器，一天也就百来块，测试后再决定。以下给出几个例子：
例1：
手头有30个结构优化的vasp任务，电子步时间不长（15s左右），离子步多，需要两三百步。8336C 64核算一个需要大约6小时，两个任务分别用32核心跑，大概率是10小时结束。
1. 三台8336，10小时可以算6个任务，两天差不多完成所有的计算。并且还可以调控优先级，先出来结果先分析，着急的结构用64核。
2. 双路9654，怎么去分配资源会是很大的问题。小任务，通信瓶颈可能更占主导，192核 vs 64核，可能就1.5~2倍的优势；如果提交多个，吃资源的任务会影响不怎么吃资源的任务。
3. 如果是2个学生用？如果是3个学生用？多台8336C会不会更好点？

例2：
杂化泛函、大体系AIMD、大模型（>200个原子，含铁磁元素...）等等，双路8336勉强能算，一个电子步骤30分钟，这种体系，双路9654可能是最优解。

例3：
过渡态，过渡态计算很有趣，5个插值，用5个节点算，如果4个插值点很快收敛，第五个很慢很慢，已经收敛的4个节点就开始休息了。双路9654可能只需要1个节点就行了，插值点逐步收敛，节点内资源就逐步释放，收敛慢计算速度逐步加快。

综上：只有适合自己的，才是最重要的。双路9654是款非常好的服务器，节能且性能强劲，AOCC和AOCl也在逐步完善。但是，但是，但是适不适合，可能需要根据自身情况选择。

lue611 发表于 2023-12-2 22:38
我大概看了一下（都是没扩展硬盘内存的），9654*2+16G内存+512Gssd纯CPU工作站67800，8383c*2+16G内存+51 ...

只有合适与否，没有好坏之分。机器还是看你需求的，明白影响计算速度的瓶颈，再做选择：
1. 如果是vasp，并且计算体系不大，150个原子以内，任务数量多；3台8336C大概率干的活多；
2. 如果任务数量不多，但是单个任务贼耗时，类似杂化泛函，9654可能优秀；
3. 如果已经有部分intel的机器了，例如：1代或者2代 xeon，可以考虑9654，配合着用，大体系、小体系都能搞定；

此外，还需要考虑：
1. 几个人用这个机器，是否需要双路9654？两个单路咋样？
2. 是否有机柜，是否有管理节点，供电是否充足;

最后，建议先租机器，实际测试再做选择。不是很懂，并且钱不充足的，我个人建议，双路9654慎选，想用9654，可以考虑单路。

Entropy.S.I 发表于 2023-12-2 18:18
光有CPU就能跑起来了？？

我尊重intel信徒

我大概看了一下（都是没扩展硬盘内存的），9654*2+16G内存+512Gssd纯CPU工作站67800，8383c*2+16G内存+512Gssd纯CPU工作站30500，整机也是贵2.22倍
8336c整机是18000，贵3.76倍
我就是觉得奇怪为什么好像性价比差不会很多而已

lue611 发表于 2023-12-2 17:48
大佬好，我查了下8336c现在是3800，9654是23000，而双路9654有双路8336c的3.18倍，那么在钱足够的情况下是 ...

光有CPU就能跑起来了？？

我尊重intel信徒