sobereva 发表于 2023-10-14 19:55 老师,具体图我上传了,请您批评指教,谢谢卢老师 |
IGMH等值面的颜色判断吸引还是互斥一般是对于平衡结构而言的,不是平衡结构颜色说明不了什么。诸如即便强行把原子间距离拉近乃至相互作用能为正了,sign(lambda2)仍然可能是负的,导致等值面颜色是蓝的。 |
牧生 发表于 2023-10-14 18:42 哇,您真的懂我的意思了,雷姆,那我想请教您一下,阴阳离子之间的极性是否代表着一把双刃剑,就是极性大了可能导致交换互斥能增加,但是也正是极性大,两者的静电相互作用也会增加,这个就得看谁的作用更大了,您说我说的对吗 |
不完全一定IGMH看到蓝色等值面,且VMD看到氢键,就认为是吸引作用,也不一定氢键数量多,吸引作用就强。 这个水二聚体的坐标,你可以拿去做IGMH分析和SAPT能量分解。IGMH图像上看到就是蓝色等值面,看起来是吸引;但是SAPT能量分解就是正值,应该就是排斥作用。我更相信SAPT能量分解的结果。 O 48.650 10.280 14.060 H 48.160 11.040 13.760 H 49.080 10.570 14.870 O 47.840 12.710 13.450 H 47.700 13.090 14.310 H 46.960 12.540 13.110 |
文字描述过于抽象,把相关的图摆出来 |
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