Frozen-Penguin 发表于 2023-10-16 19:55
看起来像文件损坏。
既然gromacs可以读取这个文件，可以考虑用gromacs将其转换为pdb格式。

谢谢老师回复。我把两条xtc都转化为pdb后，再载入VMD，均都显示418帧，依然缺帧。这就可能是我跑MD时文件的设置的问题，或者VMD的问题了。但找不到出错点

看起来像文件损坏。
既然gromacs可以读取这个文件，可以考虑用gromacs将其转换为pdb格式。

VMD载入轨迹时，提示了这个：

gromacsplugin) Error reading timestep, file does not match format
gromacsplugin) Error reading timestep, file does not match format
gromacsplugin) Error reading timestep, file does not match format
gromacsplugin) Error reading timestep, file does not match format
gromacsplugin) Error reading timestep, file does not match format
gromacsplugin) Error reading timestep, file does not match format
gromacsplugin) Error reading timestep, file does not match format
gromacsplugin) Error reading timestep, file does not match format
gromacsplugin) Error reading timestep, file does not match format
gromacsplugin) Error reading timestep, file does not match format
Info) Coordinate I/O rate 11.6 frames/sec, 17 MB/sec, 38.6 sec