径向分布函数在r接近于0的位置为什么出现小尖峰

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发布时间: 2023-10-17 10:46

各位老师好，我构建了一个金属离子和Br-共存的体系，在50 ns MD模拟后计算金属离子周围Br-分布的径向分布函数，绘图后发现RDF曲线在r接近于0处（约为0.08埃）出现了一个小尖峰，如下图红框所示。烦请各位老师指点一 ...

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芮啦 发表于 Post on 2023-10-18 09:48:57

sobereva 发表于 2023-10-18 03:53
bug或者计算设置问题
如果你用的gmx rdf算的，尝试用VMD的rdf插件算看看什么情况。并且选取轨迹的不同区段 ...

好的，谢谢卢老师的解答，我都去尝试一下

sobereva 发表于 Post on 2023-10-18 03:53:45

bug或者计算设置问题
如果你用的gmx rdf算的，尝试用VMD的rdf插件算看看什么情况。并且选取轨迹的不同区段进行统计看看哪部分轨迹导致的。

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