求助：gromacs可行性以及MgO模型的建立相关问题

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发布时间: 2023-10-17 17:16

求助大家：1.目前想实现MgO对于冰晶成核的影响同时还考虑MgO表面包覆PVP分子，不知道这个模拟过程能不能通过Gromacs来实现？ 2.关于MgO的建模问题：现实中的MgO是六方片状，六方边长为100nm，厚度为20nm，但是 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-10-18 22:22:37

ysrhhhh 发表于 2023-10-18 09:27
感谢社长的回复。
1.对于pvp的话，是聚乙烯吡咯烷酮(polyvinyl pyrrolidone)，简称PVP，是一种非离子型 ...

1 原则上需要让模拟结果随n达到收敛，做收敛性测试最为严格但也最麻烦。实际中只要长到相对于盒子尺寸来说仿佛是非常长的就够了

2 可以

3 可以

sobereva 发表于 Post on 2023-10-18 03:36:33

1 不要用PVP之类不是论坛里的人众所周知的缩写

2 不用维持。本来你就不可能建那么大的模型，能跑得动的体系只是MgO的一个局部表面，或者局部边缘，显然这跟MgO整体形态没关系

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