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gro和top文件不对应的问题

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发布时间: 2023-10-20 07:04

正文摘要:

老师,您好,我请教下关于gro和top原子数不匹配的问题。 我用packmol加了8576个水分子和2173个dmso,又加了1个配体lig和1个磷酸吡哆胺pmp,结果如下 [ molecules ] ; Compound       &n ...

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jia1012428 发表于 Post on 2023-10-20 09:39:42
奇怪,我只有这个酶是这个样子,别的都没有问题
我把top修改了之后就好了
sobereva 发表于 Post on 2023-10-20 07:17:40
自己把top里的信息改成和gro一致就完了

不说清楚完整操作细节,别人不可能知道哪一步导致不对应
本来诸如gmx genion等命令如果指定了拓扑文件就会让拓扑文件的信息和gro文件对应

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