求助Polymorph calculation分子结构扭曲，CN键与整个共轭平面不再平行

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发布时间: 2023-10-20 14:14

用Material Studio预测有机分子的晶体模型时，遇到当晶体模型在优化时，分子结构会受到力场的影响，而发生扭曲，如下图。CN键与整个共轭平面不再平行，而是发生了相对剧烈的扭转。这类情况想请教一下各位老师，该如 ...

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jwzdga 发表于 Post on 2024-12-10 01:19:38

Curry30 发表于 2023-10-21 09:39
谢谢sob的建议

你没有指定刚性组，你要把整个分子都指定为刚性组就不会出这个问题了

Curry30 发表于 Post on 2023-10-21 09:39:44

谢谢sob的建议

sobereva 发表于 Post on 2023-10-21 05:55:01

我不用M$，如果是在某种力场下出现不该有的平面性被破坏，尝试其它力场，如果没有力场能得到期望的结果，用DFT结合恰当的泛函（能合理描述弱相互作用的）做优化

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