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模拟一个MOF+CO2体系,V-rescale热浴出现问题

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发布时间: 2023-10-25 22:32

正文摘要:

模拟一个MOF+CO2体系 。 是因为V-rescale热浴的问题还是因为气体膨胀过程无法通过设定温度恒定300K来保持恒温,还是盒子太长出现bug了呢?

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Wenchuan 发表于 Post on 2023-10-31 20:51:24
Wenchuan 发表于 2023-10-30 11:13
后面的模拟又发现系统温度降低是盒子z方向太长的缘故(800 nm),看来盒子某一方向尺寸太大会出现bug。

这个bug是在NVT情况下出现,NPT下情况可能好点。
Wenchuan 发表于 Post on 2023-10-30 11:13:56
sobereva 发表于 2023-10-26 07:54
控温不是立刻把温度拉到期望的温度,有一定速度,取决于tau_t。跑足够长时间,最终早晚能维持到期望的温度

后面的模拟又发现系统温度降低是盒子z方向太长的缘故(800 nm),看来盒子某一方向尺寸太大会出现bug。
Wenchuan 发表于 Post on 2023-10-27 11:53:36
sobereva 发表于 2023-10-26 07:54
控温不是立刻把温度拉到期望的温度,有一定速度,取决于tau_t。跑足够长时间,最终早晚能维持到期望的温度

感谢解答,温度降低可能是因为气体膨胀时粒子在z方向的速度很大,计算时控温算法将此速度加入到温度计算中,所以认为温度很高并降温。但是模拟很长时间粒子温度依旧很低,气体发生团聚,温度似乎无法回升。可能解决方案是要么不要模拟气体膨胀过程,要么不对膨胀方向控温。
sobereva 发表于 Post on 2023-10-26 07:54:23
控温不是立刻把温度拉到期望的温度,有一定速度,取决于tau_t。跑足够长时间,最终早晚能维持到期望的温度

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