求助水蒸气异质成核中如何固定颗粒在体系中心

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LWM

发布时间: 2023-10-27 17:08

各位前辈好，我打算用gromacs复现文献中水蒸气在不同尺寸铜纳米颗粒表面上的凝结，目前遇到了如下问题： 1.模拟时如何固定CU颗粒的位置在体系中心呢？ 2.不同的文献在正式模拟时既有采用NVT系综的也 ...

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LWM 发表于 Post on 2023-10-29 10:10:37

本帖最后由 LWM 于 2023-10-29 10:11 编辑

好的，感谢sob老师，再请问下sob老师，我的top这样没问题么？

sobereva 发表于 Post on 2023-10-28 04:05:51

1 mdp里用freeze，将Cu颗粒的组冻住，或者用位置限制势。看下文
解析gromacs的restraint、constraint和freeze
http://sobereva.com/10

2 如果你需要模拟过程中始终保持特定温度，应当用NVT

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