z8923080 发表于 2025-11-13 20:58 请加qq群1062359603交流，单纯看一张截图无法确定。 |
| 老师，chem模块运行到这一步原子轨迹原子坐标信息储存在trjdata中报错，请问这是什么原因 |
202511132056137540..png (38.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)
| 原来的群已经满了，后续加群的伙伴请加新的QQ群：1062359603。 |
dadaoqiuzhi 发表于 2025-4-21 20:58 谢谢老师 |
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更新最新版，以飨各位。欢迎加QQ群交流，群里更新更及时。 |
Both_English_Chinese_V3.4.250414.rar
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取什么名字 发表于 2025-4-17 16:58 请加群，用群文件最新版。 |
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本帖最后由 取什么名字 于 2025-4-17 17:19 编辑 老师您好，开始运行后会报错“函数或变量 'coord_position' 无法识别”，请问该如何解决呢 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- 已解决，是因为.lammpstrj文件中的输出坐标为相对坐标，修改后运行遇到新错误，但是第1个轨迹没报错，第2个轨迹报错“无法执行赋值，因为左侧的大小为 1×16，右侧的大小为 1×15。” |
202504171718233153..png (116.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 86)
machenghu 发表于 2025-4-7 13:48 噢噢 是我理解错了，没事啦不好意思 |
| 请问RMD中的bond_analysis统计出来的数据很多都是[][]不显示，这正常吗 |
pumpkin111 发表于 2024-9-11 15:20 直接没法处理，尝试xyz文件转换成lammps+Reaxff模拟用的data文件，run 0后分析产生的文件。 |
一只小耗子 发表于 2024-9-13 10:39 根据具体目标，量子化学，分子动力学或者更宏观的Comsol建模仿真 |
pumpkin111 发表于 2024-9-19 15:33 通过脚本结合in文件调用之，甚至可考虑把RMD_digging转换编译下，具体你得探索下。 |
| 老师，请问可否直接在lammps中调用RMD digging，通过解析lammps输出的键级信息或轨迹信息，输出当前时间步长所存在的所有分子式，并与要删除的小分子片段列表进行核对。如果分子式出现在列表中，该分子中所有原子从模拟中删除。 |
| 求问大佬：请问我做电化学，阳极溶解的反应过程，lammps+reaxff够嘛 |
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