yyy1996 发表于 2019-4-1 20:46
sob老师你好，要是识别不出来怎么办呢。体系应该室友铁和钴的，刚试了一下用element里面没有这两个元素

用name来选择

sobereva 发表于 2016-9-19 20:57
索性用dynamic bond方式显示就完了

你在graphical representation的selections标签页里，在keyword栏中 ...

sob老师你好，要是识别不出来怎么办呢。体系应该室友铁和钴的，刚试了一下用element里面没有这两个元素

sobereva 发表于 2016-9-19 20:57
索性用dynamic bond方式显示就完了

你在graphical representation的selections标签页里，在keyword栏中 ...

谢谢sob老师，这个颜色的问题现在已经解决，原因是lammps默认输出的是atom type id而不是atom 的element，可以在dump_modify element中修改即可。
但是这个jump bond还是没法解决，我没有找到pbc join的原理是什么，他是根据什么把相连接的原子都给弄到一块去的。为什么每次都会留下极个别的没有处理。谢谢老师

索性用dynamic bond方式显示就完了

你在graphical representation的selections标签页里，在keyword栏中点击element，看看是否对当前体系把元素都正确识别了。正确识别了的话肯定用element着色能区分开。