求助：gromacs中MD跑完200ns后，蛋白质断裂了

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发布时间: 2023-11-2 21:50

在研究蛋白质与表面材料作用时，MD运行完200ns时,生成的md.gro文件用vmd打开，原先完整的蛋白质断裂了，且断裂的残基序号也不固定，这种情况是什么原因导致的，如何避免？

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sobereva 发表于 Post on 2023-11-3 03:57:57

先单独跑材料和蛋白质，如果都正常，8成是[molecules]和结构文件不对应，导致参数错乱

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