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gromacs中如何设置正弦波特性的压强

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Jus

发布时间: 2023-11-4 11:14

正文摘要:

本帖最后由 Jus 于 2023-11-4 23:57 编辑老师好，大家好。请问gromacs中如何设置mdp参数能够实现正弦波特性的变化的压强，感谢大家的回复。

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NGC626 发表于 Post on 前天 22:07

喵星大佬发表于 2024-3-22 06:50
你先想想你的超声发生器是多少频率的，有木有GHz级别的超声波

在MD里模拟超声本质上就是在扯淡

老师好，请问有其他方法可以模拟出类似于超声的效果吗？

喵星大佬 发表于 Post on 2024-3-22 06:50:49

你先想想你的超声发生器是多少频率的，有木有GHz级别的超声波

在MD里模拟超声本质上就是在扯淡

azero 发表于 Post on 2024-3-21 22:17:15

Jus 发表于 2023-11-6 10:41
感谢sob老师的回答，我还有一个疑问
因为我是想模拟超声环境，我了解的是需要使用这样的余弦式的随时间 ...

请问如何修改代码？能否提供教程，我也想做超声的模拟

Jus 发表于 Post on 2023-11-7 09:15:39

sobereva 发表于 2023-11-7 06:19
cos_acceleration跟你要加超声环境的目的不是一码事

好的sob老师

sobereva 发表于 Post on 2023-11-7 06:19:13

Jus 发表于 2023-11-6 10:41
感谢sob老师的回答，我还有一个疑问
因为我是想模拟超声环境，我了解的是需要使用这样的余弦式的随时间 ...

cos_acceleration跟你要加超声环境的目的不是一码事

Jus 发表于 Post on 2023-11-6 10:41:06

sobereva 发表于 2023-11-5 12:19
没法直接设
需要修改源代码来让ref-p随时间变化

感谢sob老师的回答，我还有一个疑问
因为我是想模拟超声环境，我了解的是需要使用这样的余弦式的随时间变化的压力进行非平衡模拟，同时我还要加入cos_acceleration加速度曲线振幅用于之后计算粘度。我不是很理解我想加的这种余弦变化的压力，与cos_accelerationtian的效果是等同的、只取其一就可以，还是协同的、缺一不可。
谢谢老师的回答

sobereva 发表于 Post on 2023-11-5 12:19:31

没法直接设
需要修改源代码来让ref-p随时间变化

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