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venus2gro: VENUS96 轨迹 → 多帧 gro 文件

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mizu-bai

发布时间: 2023-11-9 11:31

正文摘要:

本帖最后由 mizu-bai 于 2024-1-8 16:17 编辑 venus2gro: VENUS96 轨迹 → 多帧 gro 文件mizu-bai2023-11-09 一、简介笔者课题组一直用 VENUS96 跑 QCT，之前都是直接改 VENUS96 的源码把坐标打印出来保存成多 ...

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小西瓜123 发表于 Post on 2024-2-28 19:41:04

mizu-bai 发表于 2024-2-28 10:23
要么压缩后上传，要么你直接发我邮箱也行

我尝试跟着example里面的out文件修改我的out文件格式，可以正常运行了，谢谢您

mizu-bai 发表于 Post on 2024-2-28 10:23:02

小西瓜123 发表于 2024-2-27 16:19
您好，我用组里老师自己修改的venus跑了一个A+B=C+D的反应，用您的脚本报错‘ValueError: invalid literal ...

要么压缩后上传，要么你直接发我邮箱也行

小西瓜123 发表于 Post on 2024-2-27 16:19:03

您好，我用组里老师自己修改的venus跑了一个A+B=C+D的反应，用您的脚本报错‘ValueError: invalid literal for int() with base 10: 'FOR'’ 和example里的文件对照发现example里面是一个分子的振动，请问这种情况应该怎么处理呢？out文件太大了，没法上传

mizu-bai 发表于 Post on 2024-2-21 17:56:27

PESPES 发表于 2024-2-21 15:49
输出文件发到您的邮箱里了：您试一下能转化么？

可以正常转换，已经打包好回复了

PESPES 发表于 Post on 2024-2-21 15:49:58

mizu-bai 发表于 2024-2-21 10:27
请问初始文件是指哪个呢，似乎 VENUS96 输入文件里是不带元素符号的，如果方面的话可以借一下文件 debug ...

输出文件发到您的邮箱里了：shiragawa4519@outlook.com 您试一下能转化么？

mizu-bai 发表于 Post on 2024-2-21 10:27:00

PESPES 发表于 2024-2-21 09:42
如果初始文件里的元素符号是两位的话，例如Cl，I这种情况，无法成功转化。

请问初始文件是指哪个呢，似乎 VENUS96 输入文件里是不带元素符号的，如果方面的话可以借一下文件 debug 吗？另外 venus2gro 已经重构为 venus-trjconv 了，可以在 https://github.com/mizu-bai/venus-trjconv 下载。

PESPES 发表于 Post on 2024-2-21 09:42:39

如果初始文件里的元素符号是两位的话，例如Cl，I这种情况，无法成功转化。

exity 发表于 Post on 2023-11-9 11:45:32

四国也。

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