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稀土有机框架212超胞结构优化报错:Cholesky decomposition failed.

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发布时间: 2023-11-20 09:40

正文摘要:

体系:单胞为:C12H4Eu4O24的稀土有机框架,在2*1*2倍的扩胞之后采用BFGS结合OT的方法优化超胞结构(输入文件见inp文件) 问题:前期正常跑了5步优化,后来出现了Cholesky decomposition failed. Matrix ill condit ...

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acquaint0706 发表于 Post on 2025-7-9 08:53:32
sobereva 发表于 2025-7-9 02:53
对于原胞不够大的情况,是

好的,谢谢社长解答。
sobereva 发表于 Post on 2025-7-9 02:53:21
acquaint0706 发表于 2025-7-8 16:01
社长,请问如果想计算晶面模型吸附某分子前后的PDOS变化是不是只能用超胞计算呢?

对于原胞不够大的情况,是
acquaint0706 发表于 Post on 2025-7-8 16:01:33
sobereva 发表于 2023-12-9 05:51
考虑k点优化原胞,之后扩成超胞算个单点得到波函数文件就完了。从来没说过优化时只能用超胞

该说的都 ...

社长,请问如果想计算晶面模型吸附某分子前后的PDOS变化是不是只能用超胞计算呢?
ddddnight 发表于 Post on 2023-12-22 21:50:39
halouhapily 发表于 2023-12-22 21:28
你好,我是用sob老师编译的monopt.sh脚本快速得到优化的能量信息的

好的,谢谢你
halouhapily 发表于 Post on 2023-12-22 21:28:11
ddddnight 发表于 2023-12-14 21:28
请问您这个曲线图是怎么画的呀,怎么快速提取能量画成这种图呀

你好,我是用sob老师编译的monopt.sh脚本快速得到优化的能量信息的
ddddnight 发表于 Post on 2023-12-14 21:28:49
halouhapily 发表于 2023-12-8 16:14
请问各位老师,在cp2k优化稀土有机框架的超胞结构时,发现优化很多步之后能量偶尔有几个波动之外其他的都 ...

请问您这个曲线图是怎么画的呀,怎么快速提取能量画成这种图呀
sobereva 发表于 Post on 2023-12-9 05:51:39
halouhapily 发表于 2023-12-8 21:08
老师,是因为我想做PDOS,我在讲义上看cp2k跑PDOS只能用超胞,所以才想着先优化超胞,在算PDOS的时候读取 ...

考虑k点优化原胞,之后扩成超胞算个单点得到波函数文件就完了。从来没说过优化时只能用超胞

该说的都说了,没有可补充的
解决CP2K中SCF不收敛的方法
http://sobereva.com/665http://bbs.keinsci.com/thread-37196-1-1.html

halouhapily 发表于 Post on 2023-12-8 21:08:09
本帖最后由 halouhapily 于 2023-12-8 21:21 编辑
sobereva 发表于 2023-12-8 18:27
优化的每一轮SCF收敛得都极其糟糕,显然受力极为不准,跑下去毫无意义
既然都不用OT,还不如考虑足够的k ...

老师,是因为我想做PDOS,我在讲义上看cp2k跑PDOS只能用超胞,所以才想着先优化超胞,在算PDOS的时候读取收敛的波函数,
老师我处理这个体系超胞的SCF不收敛的问题很长时间了,只有用LBFGS方法优化时可以优化收敛,但是自洽不收敛。实在是想不出来怎么办了,还请老师能指点指点
sobereva 发表于 Post on 2023-12-8 18:27:15
halouhapily 发表于 2023-12-8 16:14
请问各位老师,在cp2k优化稀土有机框架的超胞结构时,发现优化很多步之后能量偶尔有几个波动之外其他的都 ...

优化的每一轮SCF收敛得都极其糟糕,显然受力极为不准,跑下去毫无意义
既然都不用OT,还不如考虑足够的k点而不用超胞,速度还能快得多
sobereva 发表于 Post on 2023-11-21 02:31:16
看最后一帧结构,看看还是否合理
如果没看出毛病,尝试改用对角化结合k点

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