在vmd安装目录中

谢谢大家！！靠多方信息终于解决！！
主要还是看了这个！http://sobereva.com/447

pal 发表于 2023-11-22 10:21
还是检查一下这个showorb.vmd是不是D:/VMD/showorb.vmd,还有这个文件名有没有被修改了，后缀是不是变了之类 ...

解决了！！！

还是检查一下这个showorb.vmd是不是D:/VMD/showorb.vmd,还有这个文件名有没有被修改了，后缀是不是变了之类的

sobereva 发表于 2023-11-22 03:07
VMD命令行窗口里输入pwd，返回的目录是那个，脚本就放哪个目录下。要么就写全脚本的绝对路径

我是放在这里的 但是它好像就是查找不到这个文件
Info) VMD for WIN32, version 1.9.3 (November 30, 2016)
Info) http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
Info) Email questions and bug reports to vmd@ks.uiuc.edu
Info) Please include this reference in published work using VMD:
Info)    Humphrey, W., Dalke, A. and Schulten, K., `VMD - Visual
Info)    Molecular Dynamics', J. Molec. Graphics 1996, 14.1, 33-38.
Info) -------------------------------------------------------------
Info) Multithreading available, 20 CPUs detected.
Info) Free system memory: 2047MB (100%)
Info) OpenGL renderer: NVIDIA GeForce RTX 3060 Laptop GPU/PCIe/SSE2
Info)   Features: STENCIL MDE CVA MTX NPOT PP PS GLSL(OVFGS)
Info)   Full GLSL rendering mode is available.
Info)   Textures: 2-D (32768x32768), 3-D (16384x16384x16384), Multitexture (4)
Info) Spaceball driver not installed.  Spaceball interface disabled.
Info) No joysticks found.  Joystick interface disabled.
Info) Dynamically loaded 75 plugins in directory:
Info) D:/VMD/plugins/WIN32/molfile
vmd > pwd
D:/VMD
vmd >

七尺贱 发表于 2023-11-21 19:00
在vmd.rc中加入这样一行
source后面是你showcub.vmd的路径，自己改一下

是这样吗？
Info) VMD for WIN32, version 1.9.3 (November 30, 2016)
Info) http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
Info) Email questions and bug reports to vmd@ks.uiuc.edu
Info) Please include this reference in published work using VMD:
Info)    Humphrey, W., Dalke, A. and Schulten, K., `VMD - Visual
Info)    Molecular Dynamics', J. Molec. Graphics 1996, 14.1, 33-38.
Info) -------------------------------------------------------------
Info) Multithreading available, 20 CPUs detected.
Info) Free system memory: 2047MB (100%)
Info) OpenGL renderer: NVIDIA GeForce RTX 3060 Laptop GPU/PCIe/SSE2
Info)   Features: STENCIL MDE CVA MTX NPOT PP PS GLSL(OVFGS)
Info)   Full GLSL rendering mode is available.
Info)   Textures: 2-D (32768x32768), 3-D (16384x16384x16384), Multitexture (4)
Info) Spaceball driver not installed.  Spaceball interface disabled.
Info) No joysticks found.  Joystick interface disabled.
Info) Dynamically loaded 75 plugins in directory:
Info) D:/VMD/plugins/WIN32/molfile
vmd > source D:/VMD/plugins/WIN32/molfile
couldn't read file "D:/VMD/plugins/WIN32/molfile": permission denied
vmd >

VMD命令行窗口里输入pwd，返回的目录是那个，脚本就放哪个目录下。要么就写全脚本的绝对路径

SiC77 发表于 2023-11-21 18:48
这是啥意思 展开说说 我对VMD一无所知。。。

在vmd.rc中加入这样一行

1. source D:/Professionalsofts/vmd/showcub.vmd

复制代码

source后面是你showcub.vmd的路径，自己改一下

Petal 发表于 2023-11-21 16:46
好像需要在vmd.rc中编辑保存

这是啥意思 展开说说 我对VMD一无所知。。。

看着不就是单纯没有找到文件么

好像需要在vmd.rc中编辑保存

lyj714 发表于 2023-11-21 13:15
不要用官网那个1.9.4a的vmd。换成1.9.3的再试。

还是不行！