Elden、Lord 发表于 2023-12-8 13:25 没明显问题 等值面数值取得太小,导致等值面过于膨胀 |
Elden、Lord 发表于 2023-12-8 09:39 明显定义两个片段就够了,CO一个,其它部分一个 我作的IGMH图和你的明显不一样 |
sobereva 发表于 2023-12-7 15:53 是使用的multiwfn里的 11.IGM analysis based on Hirshfeld partition of molecular density (IGMH) (JCC, 43, 539) 选项 应该是5个原子Co,N,N,O,O 是想要研究N,O对吸附CO的弱相互作用。 |
Elden、Lord 发表于 2023-12-7 15:10 看起来是IGM而非IGMH 哪来的5个分子 输出文件内容混乱,一团糟,根本没法判断计算情况 怎么设片段取决于你想研究什么。这图丑死了 |
sobereva 发表于 2023-12-2 12:13 好的,感谢sob老师,我这里可能用的波函数不合适。我再试一试,十分感谢您。 |
没看到你的输出文件,没法判断SCF收敛情况。波函数质量太差可能会导致那种情况 对你的结构我用PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH结合XY二维周期性,molden文件和输入输出文件都在附件里,用Multiwfn+VMD得到的RDG图完全正常 另外,这个体系用IRI或IGMH明显更合适 |
sobereva 发表于 2023-11-26 02:45 感谢sob老师回复,文件已经添加了。 另外我是参考您发的这篇博客做的。 使用Multiwfn结合CP2K通过NCI和IGM方法图形化考察固体和表面的弱相互作用 http://sobereva.com/588 |
不要用“周期性弱相互作用的图”来描述,Multiwfn对周期性支持的图形化考察弱相互作用方法不止一种,必须说清楚方法,仔细看 一篇最全面介绍各种弱相互作用可视化分析方法的文章已发表! http://sobereva.com/667(http://bbs.keinsci.com/thread-37629-1-1.html) 使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用 http://sobereva.com/621(http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html) 使用IRI方法图形化考察化学体系中的化学键和弱相互作用 http://sobereva.com/598(http://bbs.keinsci.com/thread-23457-1-1.html) 首先确保用的是Multiwfn最新版本,molden文件里正确加入了[Cell]信息。如果能确保,压缩molden文件上传到网盘并提供下载链接,产生molden文件的CP2K输入文件一并提供。 |
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。 |
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