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使用Acpype插件生成有机溶剂溶剂的top文件,在gromacs能量最小化出现问题

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发布时间: 2023-11-27 21:31

正文摘要:

gromacs初学者,在构建25% 的DMF有机溶剂体系中,使用了Acpype Service生成DMF.gro 和DMF.itp,在添加Na离子过程,出现报错,报错指向DMF.itp的第43行 、67行 、74行(如图1 2),然后把这些行删掉,在nvt平衡过程出 ...

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songsong.. 发表于 Post on 2023-11-29 11:25:58
wanzongliang 发表于 2023-11-28 17:04
你的itp文件貌似是有问题的

可能还有其他的问题你得仔细检查力场文件

我试试,十分感谢大佬
wanzongliang 发表于 Post on 2023-11-28 17:04:51
本帖最后由 wanzongliang 于 2023-11-28 17:07 编辑

你的itp文件貌似是有问题的

可能还有其他的问题你得仔细检查力场文件

202311281705002451..png (49.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

202311281705002451..png

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