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含三种分子的结构怎么计算其中两种分子间相互作用能

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发布时间: 2023-11-28 19:35

正文摘要:

本帖最后由 loovfnd 于 2023-11-28 19:39 编辑 在实际的科研工作中,遇到了下面这种情况,比如ABC三种分子按照这种形式排布(非线性的),怎么计算AB之间或者BC之间的相互作用能的大小(H键或者存在色散作用)。 ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-6-5 03:16:17
一条君 发表于 2024-6-4 22:14
请问老师ppt里的方法能计算在C存在下,A-B间结合的吉布斯自由能变吗?
(6楼里解答的是【ppt里计算ΔE用 ...

不能
一条君 发表于 Post on 2024-6-4 22:14:02
sobereva 发表于 2023-11-29 03:05
参考北京科音基础(中级)量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html)讲弱相互 ...

请问老师ppt里的方法能计算在C存在下,A-B间结合的吉布斯自由能变吗?
(6楼里解答的是【ppt里计算ΔE用的始终是整个复合物结构,不优化单体或二聚体】,由此是否得出不能得到吉布斯自由能变?)
loovfnd 发表于 Post on 2023-12-2 18:16:08
sobereva 发表于 2023-12-2 11:10
ppt里诸如E_BC是指B-C复合物的能量,不是B-C相互作用能

明白了,社长,感谢指导。
sobereva 发表于 Post on 2023-12-2 11:10:19
loovfnd 发表于 2023-12-1 22:34
需要算三次相互作用能,分别得到各个校正后的能量。是这样吧,社长

ppt里诸如E_BC是指B-C复合物的能量,不是B-C相互作用能
loovfnd 发表于 Post on 2023-12-1 22:34:50
sobereva 发表于 2023-12-1 05:09
ppt里计算ΔE用的始终是整个复合物结构,不优化单体或二聚体

需要算三次相互作用能,分别得到各个校正后的能量。是这样吧,社长
sobereva 发表于 Post on 2023-12-1 05:09:27
loovfnd 发表于 2023-11-30 14:37
会注意的,社长。涉及三个组分,考虑变形能,计算解离能,则用AC优化的结构。是不是可以这么理解。

ppt里计算ΔE用的始终是整个复合物结构,不优化单体或二聚体
loovfnd 发表于 Post on 2023-11-30 14:37:34
sobereva 发表于 2023-11-30 10:05
就是算个相互作用能,是否以CP方式考虑BSSE效应不是当前问题的关键
不要把“CP方法”当做算相互作用能的 ...

会注意的,社长。涉及三个组分,考虑变形能,计算解离能,则用AC优化的结构。是不是可以这么理解。
sobereva 发表于 Post on 2023-11-30 10:05:34
loovfnd 发表于 2023-11-29 10:02
请教社长,这个ΔE(A……C)=EAC-EA-EC是单独优化AC结构后,用CP方法获得吗? 还是用ABC优化好的结构中 ...

就是算个相互作用能,是否以CP方式考虑BSSE效应不是当前问题的关键
不要把“CP方法”当做算相互作用能的代名词,看下文
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html

loovfnd 发表于 Post on 2023-11-29 10:02:43
sobereva 发表于 2023-11-29 03:05
参考北京科音基础(中级)量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html)讲弱相互 ...

请教社长,这个ΔE(A……C)=EAC-EA-EC是单独优化AC结构后,用CP方法获得吗? 还是用ABC优化好的结构中把B去除后用CP计算得到的。
sobereva 发表于 Post on 2023-11-29 03:05:54
参考北京科音基础(中级)量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html)讲弱相互作用计算部分的ppt





“描述之间相互作用” 太含糊,描述方式多了去了,诸如IGMH就非常适合直观展现指定片段间的相互作用
使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html

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