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能量平衡时,itp文件中氧原子识别出错

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发布时间: 2023-11-29 22:46

正文摘要:

各位大佬好,我在对模型平衡时,一直报错。命令行为gmx grompp -f tip4p_1_en.mdp -c tip4p_1_add.pdb -p topol.top -o em.tpr -maxwarn 2。 报错为:

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Anbling 发表于 Post on 2023-12-4 15:17:44
sobereva 发表于 2023-12-1 06:08
看清楚板块再发贴,gromacs问题发到量子化学版做什么?这次给你移动了,下次乱找地方发帖直接删帖+扣分处理

好的sob老师,抱歉。
sobereva 发表于 Post on 2023-12-1 06:10:49
OPLS-AA目录下的ffnonbonded.itp里的[atomtypes]根本没有OW原子类型的定义
自己补充TIP4P-ice需要用到的原子类型定义
sobereva 发表于 Post on 2023-12-1 06:08:44
看清楚板块再发贴,gromacs问题发到量子化学版做什么?这次给你移动了,下次乱找地方发帖直接删帖+扣分处理

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